Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMX5

NENF, Neudesin, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NENFQ9UMX5 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NENFQ9UMX5 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
NENFQ9UMX5 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NENFQ9UMX5 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NENFQ9UMX5 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
NENFQ9UMX5 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NENFQ9UMX5 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NENFQ9UMX5 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
NENFQ9UMX5 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NENFQ9UMX5 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NENFQ9UMX5 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NENFQ9UMX5 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NENFQ9UMX5 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NENFQ9UMX5 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NENFQ9UMX5 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NENFQ9UMX5 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NENFQ9UMX5 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NENFQ9UMX5 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NENFQ9UMX5 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NENFQ9UMX5 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NENFQ9UMX5 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NENFQ9UMX5 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NENFQ9UMX5 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NENFQ9UMX5 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NENFQ9UMX5 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NENFQ9UMX5 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NENFQ9UMX5 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NENFQ9UMX5 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NENFQ9UMX5 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NENFQ9UMX5 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NENFQ9UMX5 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NENFQ9UMX5 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NENFQ9UMX5 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NENFQ9UMX5 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NENFQ9UMX5 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NENFQ9UMX5 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NENFQ9UMX5 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NENFQ9UMX5 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NENFQ9UMX5 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NENFQ9UMX5 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NENFQ9UMX5 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NENFQ9UMX5 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NENFQ9UMX5 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NENFQ9UMX5 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
NENFQ9UMX5 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NENFQ9UMX5 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NENFQ9UMX5 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NENFQ9UMX5 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NENFQ9UMX5 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NENFQ9UMX5 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NENFQ9UMX5 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NENFQ9UMX5 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NENFQ9UMX5 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NENFQ9UMX5 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NENFQ9UMX5 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
NENFQ9UMX5 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NENFQ9UMX5 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NENFQ9UMX5 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NENFQ9UMX5 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NENFQ9UMX5 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NENFQ9UMX5 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
NENFQ9UMX5 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NENFQ9UMX5 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NENFQ9UMX5 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NENFQ9UMX5 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NENFQ9UMX5 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NENFQ9UMX5 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
NENFQ9UMX5 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
NENFQ9UMX5 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NENFQ9UMX5 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NENFQ9UMX5 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NENFQ9UMX5 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NENFQ9UMX5 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NENFQ9UMX5 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NENFQ9UMX5 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NENFQ9UMX5 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NENFQ9UMX5 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NENFQ9UMX5 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NENFQ9UMX5 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NENFQ9UMX5 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NENFQ9UMX5 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NENFQ9UMX5 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NENFQ9UMX5 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NENFQ9UMX5 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NENFQ9UMX5 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NENFQ9UMX5 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NENFQ9UMX5 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NENFQ9UMX5 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NENFQ9UMX5 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
NENFQ9UMX5 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NENFQ9UMX5 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NENFQ9UMX5 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NENFQ9UMX5 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NENFQ9UMX5 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NENFQ9UMX5 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NENFQ9UMX5 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NENFQ9UMX5 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NENFQ9UMX5 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NENFQ9UMX5 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NENFQ9UMX5 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms