Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULE3

DENND2A, DENN domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND2AQ9ULE3 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DENND2AQ9ULE3 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DENND2AQ9ULE3 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DENND2AQ9ULE3 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DENND2AQ9ULE3 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DENND2AQ9ULE3 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DENND2AQ9ULE3 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DENND2AQ9ULE3 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DENND2AQ9ULE3 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DENND2AQ9ULE3 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
DENND2AQ9ULE3 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DENND2AQ9ULE3 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
DENND2AQ9ULE3 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
DENND2AQ9ULE3 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DENND2AQ9ULE3 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DENND2AQ9ULE3 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DENND2AQ9ULE3 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DENND2AQ9ULE3 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DENND2AQ9ULE3 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DENND2AQ9ULE3 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
DENND2AQ9ULE3 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DENND2AQ9ULE3 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DENND2AQ9ULE3 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DENND2AQ9ULE3 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DENND2AQ9ULE3 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
DENND2AQ9ULE3 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DENND2AQ9ULE3 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DENND2AQ9ULE3 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DENND2AQ9ULE3 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DENND2AQ9ULE3 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DENND2AQ9ULE3 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DENND2AQ9ULE3 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DENND2AQ9ULE3 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
DENND2AQ9ULE3 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
DENND2AQ9ULE3 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
DENND2AQ9ULE3 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DENND2AQ9ULE3 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DENND2AQ9ULE3 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DENND2AQ9ULE3 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DENND2AQ9ULE3 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DENND2AQ9ULE3 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DENND2AQ9ULE3 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
DENND2AQ9ULE3 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DENND2AQ9ULE3 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DENND2AQ9ULE3 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DENND2AQ9ULE3 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DENND2AQ9ULE3 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
DENND2AQ9ULE3 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DENND2AQ9ULE3 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DENND2AQ9ULE3 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DENND2AQ9ULE3 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DENND2AQ9ULE3 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DENND2AQ9ULE3 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DENND2AQ9ULE3 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
DENND2AQ9ULE3 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
DENND2AQ9ULE3 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DENND2AQ9ULE3 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DENND2AQ9ULE3 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DENND2AQ9ULE3 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DENND2AQ9ULE3 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
DENND2AQ9ULE3 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DENND2AQ9ULE3 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DENND2AQ9ULE3 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DENND2AQ9ULE3 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DENND2AQ9ULE3 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DENND2AQ9ULE3 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DENND2AQ9ULE3 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DENND2AQ9ULE3 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DENND2AQ9ULE3 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DENND2AQ9ULE3 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DENND2AQ9ULE3 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DENND2AQ9ULE3 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DENND2AQ9ULE3 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DENND2AQ9ULE3 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DENND2AQ9ULE3 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
DENND2AQ9ULE3 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
DENND2AQ9ULE3 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DENND2AQ9ULE3 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
DENND2AQ9ULE3 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
DENND2AQ9ULE3 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DENND2AQ9ULE3 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DENND2AQ9ULE3 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
DENND2AQ9ULE3 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DENND2AQ9ULE3 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DENND2AQ9ULE3 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DENND2AQ9ULE3 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DENND2AQ9ULE3 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DENND2AQ9ULE3 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DENND2AQ9ULE3 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DENND2AQ9ULE3 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DENND2AQ9ULE3 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DENND2AQ9ULE3 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DENND2AQ9ULE3 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DENND2AQ9ULE3 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DENND2AQ9ULE3 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DENND2AQ9ULE3 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DENND2AQ9ULE3 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DENND2AQ9ULE3 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DENND2AQ9ULE3 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DENND2AQ9ULE3 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms