Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB1

NRXN1, Neurexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN1Q9ULB1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NRXN1Q9ULB1 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NRXN1Q9ULB1 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NRXN1Q9ULB1 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NRXN1Q9ULB1 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
NRXN1Q9ULB1 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
NRXN1Q9ULB1 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NRXN1Q9ULB1 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NRXN1Q9ULB1 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NRXN1Q9ULB1 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NRXN1Q9ULB1 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NRXN1Q9ULB1 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NRXN1Q9ULB1 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NRXN1Q9ULB1 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NRXN1Q9ULB1 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
NRXN1Q9ULB1 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NRXN1Q9ULB1 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NRXN1Q9ULB1 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NRXN1Q9ULB1 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NRXN1Q9ULB1 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NRXN1Q9ULB1 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NRXN1Q9ULB1 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NRXN1Q9ULB1 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NRXN1Q9ULB1 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
NRXN1Q9ULB1 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NRXN1Q9ULB1 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
NRXN1Q9ULB1 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NRXN1Q9ULB1 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NRXN1Q9ULB1 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NRXN1Q9ULB1 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NRXN1Q9ULB1 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NRXN1Q9ULB1 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NRXN1Q9ULB1 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NRXN1Q9ULB1 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NRXN1Q9ULB1 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NRXN1Q9ULB1 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NRXN1Q9ULB1 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NRXN1Q9ULB1 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NRXN1Q9ULB1 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NRXN1Q9ULB1 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NRXN1Q9ULB1 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NRXN1Q9ULB1 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NRXN1Q9ULB1 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NRXN1Q9ULB1 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NRXN1Q9ULB1 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NRXN1Q9ULB1 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NRXN1Q9ULB1 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
NRXN1Q9ULB1 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NRXN1Q9ULB1 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NRXN1Q9ULB1 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NRXN1Q9ULB1 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NRXN1Q9ULB1 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NRXN1Q9ULB1 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
NRXN1Q9ULB1 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NRXN1Q9ULB1 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NRXN1Q9ULB1 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NRXN1Q9ULB1 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NRXN1Q9ULB1 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NRXN1Q9ULB1 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NRXN1Q9ULB1 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NRXN1Q9ULB1 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NRXN1Q9ULB1 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NRXN1Q9ULB1 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NRXN1Q9ULB1 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
NRXN1Q9ULB1 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NRXN1Q9ULB1 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NRXN1Q9ULB1 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NRXN1Q9ULB1 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NRXN1Q9ULB1 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NRXN1Q9ULB1 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NRXN1Q9ULB1 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NRXN1Q9ULB1 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NRXN1Q9ULB1 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NRXN1Q9ULB1 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NRXN1Q9ULB1 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NRXN1Q9ULB1 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NRXN1Q9ULB1 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NRXN1Q9ULB1 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NRXN1Q9ULB1 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NRXN1Q9ULB1 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NRXN1Q9ULB1 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NRXN1Q9ULB1 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NRXN1Q9ULB1 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
NRXN1Q9ULB1 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NRXN1Q9ULB1 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NRXN1Q9ULB1 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NRXN1Q9ULB1 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NRXN1Q9ULB1 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NRXN1Q9ULB1 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NRXN1Q9ULB1 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
NRXN1Q9ULB1 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
NRXN1Q9ULB1 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NRXN1Q9ULB1 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NRXN1Q9ULB1 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NRXN1Q9ULB1 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NRXN1Q9ULB1 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NRXN1Q9ULB1 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NRXN1Q9ULB1 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NRXN1Q9ULB1 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NRXN1Q9ULB1 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms