Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL19

RARRES3, Retinoic acid receptor responder protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARRES3Q9UL19 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RARRES3Q9UL19 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RARRES3Q9UL19 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RARRES3Q9UL19 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RARRES3Q9UL19 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RARRES3Q9UL19 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RARRES3Q9UL19 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RARRES3Q9UL19 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RARRES3Q9UL19 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RARRES3Q9UL19 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RARRES3Q9UL19 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RARRES3Q9UL19 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RARRES3Q9UL19 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RARRES3Q9UL19 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RARRES3Q9UL19 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RARRES3Q9UL19 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RARRES3Q9UL19 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RARRES3Q9UL19 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RARRES3Q9UL19 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RARRES3Q9UL19 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RARRES3Q9UL19 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RARRES3Q9UL19 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RARRES3Q9UL19 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RARRES3Q9UL19 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RARRES3Q9UL19 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RARRES3Q9UL19 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RARRES3Q9UL19 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RARRES3Q9UL19 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RARRES3Q9UL19 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RARRES3Q9UL19 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RARRES3Q9UL19 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RARRES3Q9UL19 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RARRES3Q9UL19 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RARRES3Q9UL19 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RARRES3Q9UL19 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RARRES3Q9UL19 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
RARRES3Q9UL19 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RARRES3Q9UL19 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RARRES3Q9UL19 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RARRES3Q9UL19 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RARRES3Q9UL19 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RARRES3Q9UL19 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RARRES3Q9UL19 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RARRES3Q9UL19 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RARRES3Q9UL19 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RARRES3Q9UL19 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RARRES3Q9UL19 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RARRES3Q9UL19 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RARRES3Q9UL19 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RARRES3Q9UL19 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RARRES3Q9UL19 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RARRES3Q9UL19 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RARRES3Q9UL19 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RARRES3Q9UL19 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RARRES3Q9UL19 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RARRES3Q9UL19 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RARRES3Q9UL19 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
RARRES3Q9UL19 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
RARRES3Q9UL19 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RARRES3Q9UL19 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RARRES3Q9UL19 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RARRES3Q9UL19 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RARRES3Q9UL19 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
RARRES3Q9UL19 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RARRES3Q9UL19 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RARRES3Q9UL19 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RARRES3Q9UL19 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RARRES3Q9UL19 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RARRES3Q9UL19 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RARRES3Q9UL19 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RARRES3Q9UL19 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RARRES3Q9UL19 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RARRES3Q9UL19 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RARRES3Q9UL19 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RARRES3Q9UL19 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RARRES3Q9UL19 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RARRES3Q9UL19 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RARRES3Q9UL19 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RARRES3Q9UL19 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RARRES3Q9UL19 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RARRES3Q9UL19 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RARRES3Q9UL19 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RARRES3Q9UL19 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RARRES3Q9UL19 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
RARRES3Q9UL19 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
RARRES3Q9UL19 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RARRES3Q9UL19 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RARRES3Q9UL19 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RARRES3Q9UL19 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RARRES3Q9UL19 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RARRES3Q9UL19 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RARRES3Q9UL19 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RARRES3Q9UL19 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RARRES3Q9UL19 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RARRES3Q9UL19 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RARRES3Q9UL19 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RARRES3Q9UL19 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RARRES3Q9UL19 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RARRES3Q9UL19 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RARRES3Q9UL19 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms