Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKR8

TSPAN16, Tetraspanin-16, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN16Q9UKR8 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TSPAN16Q9UKR8 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TSPAN16Q9UKR8 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TSPAN16Q9UKR8 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TSPAN16Q9UKR8 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TSPAN16Q9UKR8 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TSPAN16Q9UKR8 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TSPAN16Q9UKR8 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TSPAN16Q9UKR8 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TSPAN16Q9UKR8 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TSPAN16Q9UKR8 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TSPAN16Q9UKR8 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TSPAN16Q9UKR8 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TSPAN16Q9UKR8 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TSPAN16Q9UKR8 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TSPAN16Q9UKR8 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TSPAN16Q9UKR8 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TSPAN16Q9UKR8 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TSPAN16Q9UKR8 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
TSPAN16Q9UKR8 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TSPAN16Q9UKR8 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TSPAN16Q9UKR8 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TSPAN16Q9UKR8 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
TSPAN16Q9UKR8 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
TSPAN16Q9UKR8 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
TSPAN16Q9UKR8 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TSPAN16Q9UKR8 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TSPAN16Q9UKR8 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
TSPAN16Q9UKR8 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TSPAN16Q9UKR8 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TSPAN16Q9UKR8 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TSPAN16Q9UKR8 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TSPAN16Q9UKR8 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TSPAN16Q9UKR8 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TSPAN16Q9UKR8 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TSPAN16Q9UKR8 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TSPAN16Q9UKR8 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TSPAN16Q9UKR8 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TSPAN16Q9UKR8 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TSPAN16Q9UKR8 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TSPAN16Q9UKR8 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TSPAN16Q9UKR8 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TSPAN16Q9UKR8 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TSPAN16Q9UKR8 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TSPAN16Q9UKR8 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TSPAN16Q9UKR8 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TSPAN16Q9UKR8 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
TSPAN16Q9UKR8 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TSPAN16Q9UKR8 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TSPAN16Q9UKR8 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TSPAN16Q9UKR8 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TSPAN16Q9UKR8 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TSPAN16Q9UKR8 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TSPAN16Q9UKR8 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TSPAN16Q9UKR8 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TSPAN16Q9UKR8 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TSPAN16Q9UKR8 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TSPAN16Q9UKR8 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TSPAN16Q9UKR8 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TSPAN16Q9UKR8 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TSPAN16Q9UKR8 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TSPAN16Q9UKR8 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TSPAN16Q9UKR8 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TSPAN16Q9UKR8 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TSPAN16Q9UKR8 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TSPAN16Q9UKR8 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TSPAN16Q9UKR8 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TSPAN16Q9UKR8 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TSPAN16Q9UKR8 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TSPAN16Q9UKR8 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
TSPAN16Q9UKR8 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
TSPAN16Q9UKR8 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
TSPAN16Q9UKR8 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TSPAN16Q9UKR8 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TSPAN16Q9UKR8 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TSPAN16Q9UKR8 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TSPAN16Q9UKR8 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TSPAN16Q9UKR8 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TSPAN16Q9UKR8 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TSPAN16Q9UKR8 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TSPAN16Q9UKR8 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TSPAN16Q9UKR8 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TSPAN16Q9UKR8 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TSPAN16Q9UKR8 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TSPAN16Q9UKR8 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TSPAN16Q9UKR8 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TSPAN16Q9UKR8 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TSPAN16Q9UKR8 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TSPAN16Q9UKR8 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TSPAN16Q9UKR8 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TSPAN16Q9UKR8 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TSPAN16Q9UKR8 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TSPAN16Q9UKR8 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TSPAN16Q9UKR8 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TSPAN16Q9UKR8 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TSPAN16Q9UKR8 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TSPAN16Q9UKR8 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TSPAN16Q9UKR8 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TSPAN16Q9UKR8 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TSPAN16Q9UKR8 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms