Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms