Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH90

FBXO40, F-box only protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO40Q9UH90 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
FBXO40Q9UH90 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
FBXO40Q9UH90 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
FBXO40Q9UH90 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FBXO40Q9UH90 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FBXO40Q9UH90 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
FBXO40Q9UH90 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
FBXO40Q9UH90 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FBXO40Q9UH90 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FBXO40Q9UH90 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FBXO40Q9UH90 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
FBXO40Q9UH90 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FBXO40Q9UH90 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FBXO40Q9UH90 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FBXO40Q9UH90 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FBXO40Q9UH90 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FBXO40Q9UH90 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FBXO40Q9UH90 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FBXO40Q9UH90 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FBXO40Q9UH90 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FBXO40Q9UH90 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FBXO40Q9UH90 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FBXO40Q9UH90 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FBXO40Q9UH90 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FBXO40Q9UH90 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FBXO40Q9UH90 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FBXO40Q9UH90 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
FBXO40Q9UH90 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FBXO40Q9UH90 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FBXO40Q9UH90 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FBXO40Q9UH90 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FBXO40Q9UH90 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FBXO40Q9UH90 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FBXO40Q9UH90 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FBXO40Q9UH90 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FBXO40Q9UH90 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FBXO40Q9UH90 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FBXO40Q9UH90 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FBXO40Q9UH90 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FBXO40Q9UH90 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FBXO40Q9UH90 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FBXO40Q9UH90 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FBXO40Q9UH90 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FBXO40Q9UH90 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FBXO40Q9UH90 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FBXO40Q9UH90 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FBXO40Q9UH90 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FBXO40Q9UH90 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FBXO40Q9UH90 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FBXO40Q9UH90 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FBXO40Q9UH90 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FBXO40Q9UH90 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FBXO40Q9UH90 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FBXO40Q9UH90 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FBXO40Q9UH90 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FBXO40Q9UH90 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FBXO40Q9UH90 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FBXO40Q9UH90 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FBXO40Q9UH90 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FBXO40Q9UH90 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FBXO40Q9UH90 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FBXO40Q9UH90 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FBXO40Q9UH90 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FBXO40Q9UH90 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FBXO40Q9UH90 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FBXO40Q9UH90 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FBXO40Q9UH90 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FBXO40Q9UH90 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FBXO40Q9UH90 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
FBXO40Q9UH90 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FBXO40Q9UH90 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FBXO40Q9UH90 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FBXO40Q9UH90 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FBXO40Q9UH90 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FBXO40Q9UH90 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FBXO40Q9UH90 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FBXO40Q9UH90 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FBXO40Q9UH90 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FBXO40Q9UH90 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FBXO40Q9UH90 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FBXO40Q9UH90 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FBXO40Q9UH90 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FBXO40Q9UH90 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FBXO40Q9UH90 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FBXO40Q9UH90 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
FBXO40Q9UH90 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FBXO40Q9UH90 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FBXO40Q9UH90 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FBXO40Q9UH90 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FBXO40Q9UH90 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FBXO40Q9UH90 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
FBXO40Q9UH90 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
FBXO40Q9UH90 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
FBXO40Q9UH90 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
FBXO40Q9UH90 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
FBXO40Q9UH90 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FBXO40Q9UH90 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
FBXO40Q9UH90 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FBXO40Q9UH90 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
FBXO40Q9UH90 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.2 ms