Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG63

ABCF2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF2Q9UG63 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCF2Q9UG63 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCF2Q9UG63 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCF2Q9UG63 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCF2Q9UG63 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCF2Q9UG63 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCF2Q9UG63 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ABCF2Q9UG63 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ABCF2Q9UG63 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ABCF2Q9UG63 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ABCF2Q9UG63 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ABCF2Q9UG63 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ABCF2Q9UG63 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ABCF2Q9UG63 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ABCF2Q9UG63 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ABCF2Q9UG63 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ABCF2Q9UG63 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ABCF2Q9UG63 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ABCF2Q9UG63 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ABCF2Q9UG63 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ABCF2Q9UG63 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ABCF2Q9UG63 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ABCF2Q9UG63 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ABCF2Q9UG63 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ABCF2Q9UG63 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ABCF2Q9UG63 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ABCF2Q9UG63 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ABCF2Q9UG63 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ABCF2Q9UG63 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCF2Q9UG63 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCF2Q9UG63 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCF2Q9UG63 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCF2Q9UG63 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCF2Q9UG63 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCF2Q9UG63 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCF2Q9UG63 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCF2Q9UG63 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCF2Q9UG63 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCF2Q9UG63 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCF2Q9UG63 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCF2Q9UG63 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCF2Q9UG63 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCF2Q9UG63 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCF2Q9UG63 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCF2Q9UG63 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCF2Q9UG63 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCF2Q9UG63 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCF2Q9UG63 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCF2Q9UG63 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ABCF2Q9UG63 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ABCF2Q9UG63 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ABCF2Q9UG63 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ABCF2Q9UG63 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ABCF2Q9UG63 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ABCF2Q9UG63 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ABCF2Q9UG63 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ABCF2Q9UG63 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ABCF2Q9UG63 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ABCF2Q9UG63 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ABCF2Q9UG63 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ABCF2Q9UG63 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ABCF2Q9UG63 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ABCF2Q9UG63 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ABCF2Q9UG63 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ABCF2Q9UG63 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ABCF2Q9UG63 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ABCF2Q9UG63 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ABCF2Q9UG63 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ABCF2Q9UG63 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ABCF2Q9UG63 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ABCF2Q9UG63 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ABCF2Q9UG63 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ABCF2Q9UG63 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ABCF2Q9UG63 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ABCF2Q9UG63 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ABCF2Q9UG63 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ABCF2Q9UG63 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ABCF2Q9UG63 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCF2Q9UG63 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCF2Q9UG63 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCF2Q9UG63 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCF2Q9UG63 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCF2Q9UG63 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCF2Q9UG63 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCF2Q9UG63 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCF2Q9UG63 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCF2Q9UG63 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCF2Q9UG63 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCF2Q9UG63 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCF2Q9UG63 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCF2Q9UG63 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCF2Q9UG63 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCF2Q9UG63 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCF2Q9UG63 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCF2Q9UG63 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCF2Q9UG63 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCF2Q9UG63 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCF2Q9UG63 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCF2Q9UG63 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCF2Q9UG63 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms