Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG01

IFT172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT172Q9UG01 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
IFT172Q9UG01 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
IFT172Q9UG01 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
IFT172Q9UG01 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
IFT172Q9UG01 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
IFT172Q9UG01 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
IFT172Q9UG01 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
IFT172Q9UG01 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
IFT172Q9UG01 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
IFT172Q9UG01 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
IFT172Q9UG01 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
IFT172Q9UG01 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
IFT172Q9UG01 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
IFT172Q9UG01 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
IFT172Q9UG01 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
IFT172Q9UG01 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
IFT172Q9UG01 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
IFT172Q9UG01 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
IFT172Q9UG01 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
IFT172Q9UG01 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
IFT172Q9UG01 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
IFT172Q9UG01 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
IFT172Q9UG01 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
IFT172Q9UG01 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
IFT172Q9UG01 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
IFT172Q9UG01 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
IFT172Q9UG01 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
IFT172Q9UG01 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
IFT172Q9UG01 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
IFT172Q9UG01 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
IFT172Q9UG01 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
IFT172Q9UG01 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
IFT172Q9UG01 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
IFT172Q9UG01 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
IFT172Q9UG01 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
IFT172Q9UG01 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
IFT172Q9UG01 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
IFT172Q9UG01 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
IFT172Q9UG01 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
IFT172Q9UG01 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
IFT172Q9UG01 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
IFT172Q9UG01 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
IFT172Q9UG01 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
IFT172Q9UG01 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
IFT172Q9UG01 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
IFT172Q9UG01 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
IFT172Q9UG01 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
IFT172Q9UG01 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
IFT172Q9UG01 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
IFT172Q9UG01 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
IFT172Q9UG01 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
IFT172Q9UG01 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
IFT172Q9UG01 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
IFT172Q9UG01 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
IFT172Q9UG01 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
IFT172Q9UG01 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
IFT172Q9UG01 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
IFT172Q9UG01 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
IFT172Q9UG01 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
IFT172Q9UG01 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
IFT172Q9UG01 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
IFT172Q9UG01 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
IFT172Q9UG01 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
IFT172Q9UG01 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
IFT172Q9UG01 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
IFT172Q9UG01 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
IFT172Q9UG01 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
IFT172Q9UG01 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
IFT172Q9UG01 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
IFT172Q9UG01 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
IFT172Q9UG01 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
IFT172Q9UG01 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
IFT172Q9UG01 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
IFT172Q9UG01 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
IFT172Q9UG01 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
IFT172Q9UG01 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
IFT172Q9UG01 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
IFT172Q9UG01 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
IFT172Q9UG01 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
IFT172Q9UG01 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
IFT172Q9UG01 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
IFT172Q9UG01 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
IFT172Q9UG01 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
IFT172Q9UG01 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
IFT172Q9UG01 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
IFT172Q9UG01 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
IFT172Q9UG01 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
IFT172Q9UG01 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
IFT172Q9UG01 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
IFT172Q9UG01 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
IFT172Q9UG01 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
IFT172Q9UG01 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
IFT172Q9UG01 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
IFT172Q9UG01 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
IFT172Q9UG01 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
IFT172Q9UG01 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
IFT172Q9UG01 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
IFT172Q9UG01 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
IFT172Q9UG01 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
IFT172Q9UG01 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms