Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP4

DKK3, Dickkopf-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK3Q9UBP4 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DKK3Q9UBP4 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DKK3Q9UBP4 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DKK3Q9UBP4 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DKK3Q9UBP4 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
DKK3Q9UBP4 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
DKK3Q9UBP4 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
DKK3Q9UBP4 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
DKK3Q9UBP4 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DKK3Q9UBP4 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DKK3Q9UBP4 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DKK3Q9UBP4 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DKK3Q9UBP4 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DKK3Q9UBP4 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DKK3Q9UBP4 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DKK3Q9UBP4 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DKK3Q9UBP4 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DKK3Q9UBP4 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DKK3Q9UBP4 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DKK3Q9UBP4 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
DKK3Q9UBP4 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
DKK3Q9UBP4 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DKK3Q9UBP4 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DKK3Q9UBP4 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DKK3Q9UBP4 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DKK3Q9UBP4 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
DKK3Q9UBP4 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DKK3Q9UBP4 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DKK3Q9UBP4 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DKK3Q9UBP4 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DKK3Q9UBP4 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DKK3Q9UBP4 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DKK3Q9UBP4 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DKK3Q9UBP4 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DKK3Q9UBP4 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DKK3Q9UBP4 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DKK3Q9UBP4 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DKK3Q9UBP4 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DKK3Q9UBP4 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DKK3Q9UBP4 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DKK3Q9UBP4 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DKK3Q9UBP4 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
DKK3Q9UBP4 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DKK3Q9UBP4 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DKK3Q9UBP4 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DKK3Q9UBP4 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DKK3Q9UBP4 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DKK3Q9UBP4 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DKK3Q9UBP4 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
DKK3Q9UBP4 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DKK3Q9UBP4 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
DKK3Q9UBP4 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DKK3Q9UBP4 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DKK3Q9UBP4 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DKK3Q9UBP4 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DKK3Q9UBP4 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DKK3Q9UBP4 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DKK3Q9UBP4 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DKK3Q9UBP4 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DKK3Q9UBP4 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DKK3Q9UBP4 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DKK3Q9UBP4 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DKK3Q9UBP4 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DKK3Q9UBP4 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DKK3Q9UBP4 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DKK3Q9UBP4 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DKK3Q9UBP4 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DKK3Q9UBP4 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DKK3Q9UBP4 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DKK3Q9UBP4 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DKK3Q9UBP4 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DKK3Q9UBP4 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DKK3Q9UBP4 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DKK3Q9UBP4 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DKK3Q9UBP4 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DKK3Q9UBP4 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DKK3Q9UBP4 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DKK3Q9UBP4 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DKK3Q9UBP4 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DKK3Q9UBP4 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DKK3Q9UBP4 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DKK3Q9UBP4 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DKK3Q9UBP4 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DKK3Q9UBP4 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DKK3Q9UBP4 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DKK3Q9UBP4 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DKK3Q9UBP4 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DKK3Q9UBP4 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DKK3Q9UBP4 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DKK3Q9UBP4 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DKK3Q9UBP4 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DKK3Q9UBP4 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DKK3Q9UBP4 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DKK3Q9UBP4 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
DKK3Q9UBP4 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DKK3Q9UBP4 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DKK3Q9UBP4 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DKK3Q9UBP4 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
DKK3Q9UBP4 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DKK3Q9UBP4 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms