Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF2

COPG2, Coatomer subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPG2Q9UBF2 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
COPG2Q9UBF2 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
COPG2Q9UBF2 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COPG2Q9UBF2 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COPG2Q9UBF2 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COPG2Q9UBF2 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
COPG2Q9UBF2 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
COPG2Q9UBF2 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COPG2Q9UBF2 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COPG2Q9UBF2 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COPG2Q9UBF2 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COPG2Q9UBF2 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COPG2Q9UBF2 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COPG2Q9UBF2 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
COPG2Q9UBF2 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COPG2Q9UBF2 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
COPG2Q9UBF2 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
COPG2Q9UBF2 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
COPG2Q9UBF2 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
COPG2Q9UBF2 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COPG2Q9UBF2 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
COPG2Q9UBF2 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COPG2Q9UBF2 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COPG2Q9UBF2 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
COPG2Q9UBF2 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COPG2Q9UBF2 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COPG2Q9UBF2 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COPG2Q9UBF2 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COPG2Q9UBF2 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COPG2Q9UBF2 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COPG2Q9UBF2 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COPG2Q9UBF2 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COPG2Q9UBF2 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COPG2Q9UBF2 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COPG2Q9UBF2 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COPG2Q9UBF2 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COPG2Q9UBF2 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COPG2Q9UBF2 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COPG2Q9UBF2 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COPG2Q9UBF2 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COPG2Q9UBF2 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COPG2Q9UBF2 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COPG2Q9UBF2 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COPG2Q9UBF2 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COPG2Q9UBF2 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COPG2Q9UBF2 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COPG2Q9UBF2 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
COPG2Q9UBF2 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
COPG2Q9UBF2 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
COPG2Q9UBF2 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COPG2Q9UBF2 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COPG2Q9UBF2 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COPG2Q9UBF2 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COPG2Q9UBF2 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COPG2Q9UBF2 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COPG2Q9UBF2 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COPG2Q9UBF2 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COPG2Q9UBF2 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COPG2Q9UBF2 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COPG2Q9UBF2 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
COPG2Q9UBF2 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
COPG2Q9UBF2 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
COPG2Q9UBF2 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
COPG2Q9UBF2 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
COPG2Q9UBF2 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
COPG2Q9UBF2 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
COPG2Q9UBF2 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
COPG2Q9UBF2 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
COPG2Q9UBF2 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
COPG2Q9UBF2 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
COPG2Q9UBF2 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
COPG2Q9UBF2 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
COPG2Q9UBF2 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
COPG2Q9UBF2 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
COPG2Q9UBF2 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
COPG2Q9UBF2 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
COPG2Q9UBF2 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
COPG2Q9UBF2 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
COPG2Q9UBF2 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
COPG2Q9UBF2 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
COPG2Q9UBF2 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
COPG2Q9UBF2 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
COPG2Q9UBF2 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
COPG2Q9UBF2 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms