Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J3

KLHL9, Kelch-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL9Q9P2J3 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms