Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CHPF2Q9P2E5 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHPF2Q9P2E5 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CHPF2Q9P2E5 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHPF2Q9P2E5 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHPF2Q9P2E5 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHPF2Q9P2E5 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHPF2Q9P2E5 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHPF2Q9P2E5 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHPF2Q9P2E5 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHPF2Q9P2E5 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHPF2Q9P2E5 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHPF2Q9P2E5 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHPF2Q9P2E5 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHPF2Q9P2E5 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHPF2Q9P2E5 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHPF2Q9P2E5 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHPF2Q9P2E5 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHPF2Q9P2E5 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHPF2Q9P2E5 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHPF2Q9P2E5 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHPF2Q9P2E5 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHPF2Q9P2E5 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHPF2Q9P2E5 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHPF2Q9P2E5 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHPF2Q9P2E5 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CHPF2Q9P2E5 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CHPF2Q9P2E5 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHPF2Q9P2E5 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHPF2Q9P2E5 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CHPF2Q9P2E5 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHPF2Q9P2E5 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHPF2Q9P2E5 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHPF2Q9P2E5 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHPF2Q9P2E5 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHPF2Q9P2E5 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHPF2Q9P2E5 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHPF2Q9P2E5 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHPF2Q9P2E5 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHPF2Q9P2E5 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHPF2Q9P2E5 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHPF2Q9P2E5 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHPF2Q9P2E5 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHPF2Q9P2E5 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHPF2Q9P2E5 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CHPF2Q9P2E5 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHPF2Q9P2E5 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CHPF2Q9P2E5 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CHPF2Q9P2E5 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHPF2Q9P2E5 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHPF2Q9P2E5 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHPF2Q9P2E5 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CHPF2Q9P2E5 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHPF2Q9P2E5 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHPF2Q9P2E5 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHPF2Q9P2E5 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHPF2Q9P2E5 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHPF2Q9P2E5 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHPF2Q9P2E5 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHPF2Q9P2E5 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHPF2Q9P2E5 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHPF2Q9P2E5 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHPF2Q9P2E5 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHPF2Q9P2E5 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHPF2Q9P2E5 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHPF2Q9P2E5 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHPF2Q9P2E5 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHPF2Q9P2E5 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHPF2Q9P2E5 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHPF2Q9P2E5 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHPF2Q9P2E5 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHPF2Q9P2E5 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHPF2Q9P2E5 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHPF2Q9P2E5 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CHPF2Q9P2E5 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CHPF2Q9P2E5 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHPF2Q9P2E5 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CHPF2Q9P2E5 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHPF2Q9P2E5 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHPF2Q9P2E5 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHPF2Q9P2E5 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CHPF2Q9P2E5 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CHPF2Q9P2E5 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHPF2Q9P2E5 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHPF2Q9P2E5 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHPF2Q9P2E5 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHPF2Q9P2E5 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CHPF2Q9P2E5 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHPF2Q9P2E5 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHPF2Q9P2E5 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHPF2Q9P2E5 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHPF2Q9P2E5 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CHPF2Q9P2E5 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHPF2Q9P2E5 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHPF2Q9P2E5 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHPF2Q9P2E5 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHPF2Q9P2E5 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHPF2Q9P2E5 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHPF2Q9P2E5 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHPF2Q9P2E5 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms