Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HCN3Q9P1Z3 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
HCN3Q9P1Z3 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
HCN3Q9P1Z3 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
HCN3Q9P1Z3 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.38
HCN3Q9P1Z3 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
HCN3Q9P1Z3 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HCN3Q9P1Z3 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HCN3Q9P1Z3 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
HCN3Q9P1Z3 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HCN3Q9P1Z3 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HCN3Q9P1Z3 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HCN3Q9P1Z3 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HCN3Q9P1Z3 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HCN3Q9P1Z3 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HCN3Q9P1Z3 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HCN3Q9P1Z3 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HCN3Q9P1Z3 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HCN3Q9P1Z3 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HCN3Q9P1Z3 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HCN3Q9P1Z3 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HCN3Q9P1Z3 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HCN3Q9P1Z3 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HCN3Q9P1Z3 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HCN3Q9P1Z3 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HCN3Q9P1Z3 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HCN3Q9P1Z3 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HCN3Q9P1Z3 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HCN3Q9P1Z3 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HCN3Q9P1Z3 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HCN3Q9P1Z3 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HCN3Q9P1Z3 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HCN3Q9P1Z3 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HCN3Q9P1Z3 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HCN3Q9P1Z3 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HCN3Q9P1Z3 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HCN3Q9P1Z3 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HCN3Q9P1Z3 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HCN3Q9P1Z3 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HCN3Q9P1Z3 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HCN3Q9P1Z3 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HCN3Q9P1Z3 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HCN3Q9P1Z3 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HCN3Q9P1Z3 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HCN3Q9P1Z3 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HCN3Q9P1Z3 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HCN3Q9P1Z3 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
HCN3Q9P1Z3 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HCN3Q9P1Z3 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
HCN3Q9P1Z3 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
HCN3Q9P1Z3 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HCN3Q9P1Z3 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HCN3Q9P1Z3 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HCN3Q9P1Z3 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HCN3Q9P1Z3 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HCN3Q9P1Z3 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HCN3Q9P1Z3 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HCN3Q9P1Z3 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HCN3Q9P1Z3 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HCN3Q9P1Z3 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HCN3Q9P1Z3 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HCN3Q9P1Z3 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HCN3Q9P1Z3 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HCN3Q9P1Z3 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
HCN3Q9P1Z3 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HCN3Q9P1Z3 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HCN3Q9P1Z3 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HCN3Q9P1Z3 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HCN3Q9P1Z3 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HCN3Q9P1Z3 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HCN3Q9P1Z3 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HCN3Q9P1Z3 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HCN3Q9P1Z3 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HCN3Q9P1Z3 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HCN3Q9P1Z3 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HCN3Q9P1Z3 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HCN3Q9P1Z3 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HCN3Q9P1Z3 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HCN3Q9P1Z3 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HCN3Q9P1Z3 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HCN3Q9P1Z3 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
HCN3Q9P1Z3 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HCN3Q9P1Z3 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HCN3Q9P1Z3 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HCN3Q9P1Z3 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HCN3Q9P1Z3 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HCN3Q9P1Z3 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HCN3Q9P1Z3 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HCN3Q9P1Z3 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HCN3Q9P1Z3 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HCN3Q9P1Z3 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HCN3Q9P1Z3 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HCN3Q9P1Z3 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
HCN3Q9P1Z3 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HCN3Q9P1Z3 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HCN3Q9P1Z3 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HCN3Q9P1Z3 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HCN3Q9P1Z3 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
HCN3Q9P1Z3 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HCN3Q9P1Z3 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms