Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J7

KCMF1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCMF1Q9P0J7 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms