Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZZ3

CHMP5, Charged multivesicular body protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP5Q9NZZ3 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CHMP5Q9NZZ3 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CHMP5Q9NZZ3 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CHMP5Q9NZZ3 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHMP5Q9NZZ3 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHMP5Q9NZZ3 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHMP5Q9NZZ3 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHMP5Q9NZZ3 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHMP5Q9NZZ3 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHMP5Q9NZZ3 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHMP5Q9NZZ3 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHMP5Q9NZZ3 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHMP5Q9NZZ3 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHMP5Q9NZZ3 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHMP5Q9NZZ3 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHMP5Q9NZZ3 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHMP5Q9NZZ3 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHMP5Q9NZZ3 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHMP5Q9NZZ3 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CHMP5Q9NZZ3 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHMP5Q9NZZ3 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHMP5Q9NZZ3 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHMP5Q9NZZ3 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHMP5Q9NZZ3 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHMP5Q9NZZ3 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHMP5Q9NZZ3 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHMP5Q9NZZ3 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CHMP5Q9NZZ3 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHMP5Q9NZZ3 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHMP5Q9NZZ3 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHMP5Q9NZZ3 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHMP5Q9NZZ3 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHMP5Q9NZZ3 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHMP5Q9NZZ3 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHMP5Q9NZZ3 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHMP5Q9NZZ3 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHMP5Q9NZZ3 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHMP5Q9NZZ3 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHMP5Q9NZZ3 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHMP5Q9NZZ3 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHMP5Q9NZZ3 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHMP5Q9NZZ3 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHMP5Q9NZZ3 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHMP5Q9NZZ3 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHMP5Q9NZZ3 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHMP5Q9NZZ3 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHMP5Q9NZZ3 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHMP5Q9NZZ3 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHMP5Q9NZZ3 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHMP5Q9NZZ3 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CHMP5Q9NZZ3 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHMP5Q9NZZ3 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHMP5Q9NZZ3 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHMP5Q9NZZ3 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHMP5Q9NZZ3 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHMP5Q9NZZ3 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHMP5Q9NZZ3 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHMP5Q9NZZ3 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHMP5Q9NZZ3 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHMP5Q9NZZ3 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHMP5Q9NZZ3 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHMP5Q9NZZ3 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHMP5Q9NZZ3 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHMP5Q9NZZ3 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHMP5Q9NZZ3 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHMP5Q9NZZ3 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHMP5Q9NZZ3 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHMP5Q9NZZ3 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHMP5Q9NZZ3 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHMP5Q9NZZ3 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHMP5Q9NZZ3 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHMP5Q9NZZ3 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHMP5Q9NZZ3 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHMP5Q9NZZ3 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHMP5Q9NZZ3 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHMP5Q9NZZ3 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHMP5Q9NZZ3 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHMP5Q9NZZ3 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHMP5Q9NZZ3 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHMP5Q9NZZ3 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CHMP5Q9NZZ3 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHMP5Q9NZZ3 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHMP5Q9NZZ3 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHMP5Q9NZZ3 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHMP5Q9NZZ3 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHMP5Q9NZZ3 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHMP5Q9NZZ3 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHMP5Q9NZZ3 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHMP5Q9NZZ3 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHMP5Q9NZZ3 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHMP5Q9NZZ3 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHMP5Q9NZZ3 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHMP5Q9NZZ3 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHMP5Q9NZZ3 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CHMP5Q9NZZ3 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CHMP5Q9NZZ3 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHMP5Q9NZZ3 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHMP5Q9NZZ3 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHMP5Q9NZZ3 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHMP5Q9NZZ3 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms