Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYF3

FAM53C, Protein FAM53C, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53CQ9NYF3 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
FAM53CQ9NYF3 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
FAM53CQ9NYF3 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FAM53CQ9NYF3 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
FAM53CQ9NYF3 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
FAM53CQ9NYF3 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
FAM53CQ9NYF3 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FAM53CQ9NYF3 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
FAM53CQ9NYF3 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FAM53CQ9NYF3 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FAM53CQ9NYF3 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FAM53CQ9NYF3 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FAM53CQ9NYF3 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FAM53CQ9NYF3 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
FAM53CQ9NYF3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FAM53CQ9NYF3 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
FAM53CQ9NYF3 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
FAM53CQ9NYF3 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
FAM53CQ9NYF3 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
FAM53CQ9NYF3 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FAM53CQ9NYF3 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
FAM53CQ9NYF3 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FAM53CQ9NYF3 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
FAM53CQ9NYF3 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FAM53CQ9NYF3 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
FAM53CQ9NYF3 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FAM53CQ9NYF3 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FAM53CQ9NYF3 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FAM53CQ9NYF3 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FAM53CQ9NYF3 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FAM53CQ9NYF3 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
FAM53CQ9NYF3 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FAM53CQ9NYF3 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FAM53CQ9NYF3 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FAM53CQ9NYF3 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
FAM53CQ9NYF3 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FAM53CQ9NYF3 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
FAM53CQ9NYF3 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FAM53CQ9NYF3 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
FAM53CQ9NYF3 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
FAM53CQ9NYF3 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
FAM53CQ9NYF3 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
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FAM53CQ9NYF3 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
FAM53CQ9NYF3 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
FAM53CQ9NYF3 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
FAM53CQ9NYF3 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FAM53CQ9NYF3 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
FAM53CQ9NYF3 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
FAM53CQ9NYF3 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FAM53CQ9NYF3 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
FAM53CQ9NYF3 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
FAM53CQ9NYF3 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
FAM53CQ9NYF3 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FAM53CQ9NYF3 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
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FAM53CQ9NYF3 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FAM53CQ9NYF3 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FAM53CQ9NYF3 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FAM53CQ9NYF3 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
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FAM53CQ9NYF3 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
FAM53CQ9NYF3 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FAM53CQ9NYF3 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FAM53CQ9NYF3 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FAM53CQ9NYF3 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FAM53CQ9NYF3 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
FAM53CQ9NYF3 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
FAM53CQ9NYF3 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
FAM53CQ9NYF3 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
FAM53CQ9NYF3 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
FAM53CQ9NYF3 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
FAM53CQ9NYF3 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
FAM53CQ9NYF3 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
FAM53CQ9NYF3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
FAM53CQ9NYF3 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
FAM53CQ9NYF3 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
FAM53CQ9NYF3 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
FAM53CQ9NYF3 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
FAM53CQ9NYF3 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
FAM53CQ9NYF3 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
FAM53CQ9NYF3 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
FAM53CQ9NYF3 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
FAM53CQ9NYF3 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
FAM53CQ9NYF3 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
FAM53CQ9NYF3 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
FAM53CQ9NYF3 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
FAM53CQ9NYF3 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
FAM53CQ9NYF3 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
FAM53CQ9NYF3 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
FAM53CQ9NYF3 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
FAM53CQ9NYF3 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
FAM53CQ9NYF3 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
FAM53CQ9NYF3 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.58
FAM53CQ9NYF3 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
FAM53CQ9NYF3 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
FAM53CQ9NYF3 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
FAM53CQ9NYF3 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
FAM53CQ9NYF3 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
FAM53CQ9NYF3 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
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