Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXH8

TOR4A, Torsin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOR4AQ9NXH8 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TOR4AQ9NXH8 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TOR4AQ9NXH8 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TOR4AQ9NXH8 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TOR4AQ9NXH8 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TOR4AQ9NXH8 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TOR4AQ9NXH8 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TOR4AQ9NXH8 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TOR4AQ9NXH8 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TOR4AQ9NXH8 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TOR4AQ9NXH8 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TOR4AQ9NXH8 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TOR4AQ9NXH8 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TOR4AQ9NXH8 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TOR4AQ9NXH8 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TOR4AQ9NXH8 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TOR4AQ9NXH8 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TOR4AQ9NXH8 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TOR4AQ9NXH8 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TOR4AQ9NXH8 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TOR4AQ9NXH8 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TOR4AQ9NXH8 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TOR4AQ9NXH8 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TOR4AQ9NXH8 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TOR4AQ9NXH8 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TOR4AQ9NXH8 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TOR4AQ9NXH8 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TOR4AQ9NXH8 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TOR4AQ9NXH8 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TOR4AQ9NXH8 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TOR4AQ9NXH8 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TOR4AQ9NXH8 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TOR4AQ9NXH8 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TOR4AQ9NXH8 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TOR4AQ9NXH8 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TOR4AQ9NXH8 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TOR4AQ9NXH8 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TOR4AQ9NXH8 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TOR4AQ9NXH8 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TOR4AQ9NXH8 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TOR4AQ9NXH8 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TOR4AQ9NXH8 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TOR4AQ9NXH8 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TOR4AQ9NXH8 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TOR4AQ9NXH8 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TOR4AQ9NXH8 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TOR4AQ9NXH8 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TOR4AQ9NXH8 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TOR4AQ9NXH8 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TOR4AQ9NXH8 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TOR4AQ9NXH8 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TOR4AQ9NXH8 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TOR4AQ9NXH8 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TOR4AQ9NXH8 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TOR4AQ9NXH8 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TOR4AQ9NXH8 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TOR4AQ9NXH8 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TOR4AQ9NXH8 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TOR4AQ9NXH8 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TOR4AQ9NXH8 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TOR4AQ9NXH8 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TOR4AQ9NXH8 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TOR4AQ9NXH8 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TOR4AQ9NXH8 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TOR4AQ9NXH8 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TOR4AQ9NXH8 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TOR4AQ9NXH8 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TOR4AQ9NXH8 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TOR4AQ9NXH8 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TOR4AQ9NXH8 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TOR4AQ9NXH8 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TOR4AQ9NXH8 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TOR4AQ9NXH8 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TOR4AQ9NXH8 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TOR4AQ9NXH8 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TOR4AQ9NXH8 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TOR4AQ9NXH8 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TOR4AQ9NXH8 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TOR4AQ9NXH8 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TOR4AQ9NXH8 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TOR4AQ9NXH8 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TOR4AQ9NXH8 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TOR4AQ9NXH8 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TOR4AQ9NXH8 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TOR4AQ9NXH8 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TOR4AQ9NXH8 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TOR4AQ9NXH8 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TOR4AQ9NXH8 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TOR4AQ9NXH8 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TOR4AQ9NXH8 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TOR4AQ9NXH8 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TOR4AQ9NXH8 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TOR4AQ9NXH8 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TOR4AQ9NXH8 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TOR4AQ9NXH8 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TOR4AQ9NXH8 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TOR4AQ9NXH8 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TOR4AQ9NXH8 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TOR4AQ9NXH8 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TOR4AQ9NXH8 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms