Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVX2

NLE1, Notchless protein homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLE1Q9NVX2 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NLE1Q9NVX2 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NLE1Q9NVX2 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NLE1Q9NVX2 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NLE1Q9NVX2 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NLE1Q9NVX2 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NLE1Q9NVX2 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NLE1Q9NVX2 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NLE1Q9NVX2 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NLE1Q9NVX2 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NLE1Q9NVX2 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NLE1Q9NVX2 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NLE1Q9NVX2 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NLE1Q9NVX2 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NLE1Q9NVX2 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NLE1Q9NVX2 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NLE1Q9NVX2 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NLE1Q9NVX2 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NLE1Q9NVX2 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NLE1Q9NVX2 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NLE1Q9NVX2 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NLE1Q9NVX2 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NLE1Q9NVX2 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NLE1Q9NVX2 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NLE1Q9NVX2 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NLE1Q9NVX2 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NLE1Q9NVX2 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NLE1Q9NVX2 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NLE1Q9NVX2 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NLE1Q9NVX2 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NLE1Q9NVX2 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NLE1Q9NVX2 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NLE1Q9NVX2 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NLE1Q9NVX2 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NLE1Q9NVX2 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NLE1Q9NVX2 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NLE1Q9NVX2 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
NLE1Q9NVX2 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NLE1Q9NVX2 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NLE1Q9NVX2 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NLE1Q9NVX2 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
NLE1Q9NVX2 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NLE1Q9NVX2 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NLE1Q9NVX2 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NLE1Q9NVX2 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NLE1Q9NVX2 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NLE1Q9NVX2 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NLE1Q9NVX2 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
NLE1Q9NVX2 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NLE1Q9NVX2 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
NLE1Q9NVX2 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NLE1Q9NVX2 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NLE1Q9NVX2 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NLE1Q9NVX2 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NLE1Q9NVX2 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NLE1Q9NVX2 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NLE1Q9NVX2 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NLE1Q9NVX2 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NLE1Q9NVX2 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NLE1Q9NVX2 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
NLE1Q9NVX2 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NLE1Q9NVX2 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NLE1Q9NVX2 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NLE1Q9NVX2 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NLE1Q9NVX2 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NLE1Q9NVX2 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NLE1Q9NVX2 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NLE1Q9NVX2 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NLE1Q9NVX2 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NLE1Q9NVX2 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NLE1Q9NVX2 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NLE1Q9NVX2 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NLE1Q9NVX2 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NLE1Q9NVX2 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
NLE1Q9NVX2 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NLE1Q9NVX2 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NLE1Q9NVX2 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NLE1Q9NVX2 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NLE1Q9NVX2 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NLE1Q9NVX2 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NLE1Q9NVX2 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NLE1Q9NVX2 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NLE1Q9NVX2 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NLE1Q9NVX2 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NLE1Q9NVX2 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NLE1Q9NVX2 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NLE1Q9NVX2 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NLE1Q9NVX2 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NLE1Q9NVX2 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NLE1Q9NVX2 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NLE1Q9NVX2 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NLE1Q9NVX2 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NLE1Q9NVX2 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NLE1Q9NVX2 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NLE1Q9NVX2 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NLE1Q9NVX2 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NLE1Q9NVX2 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NLE1Q9NVX2 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NLE1Q9NVX2 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NLE1Q9NVX2 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms