Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD4

ZNF275, Zinc finger protein 275, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF275Q9NSD4 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ZNF275Q9NSD4 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ZNF275Q9NSD4 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ZNF275Q9NSD4 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ZNF275Q9NSD4 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ZNF275Q9NSD4 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ZNF275Q9NSD4 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ZNF275Q9NSD4 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ZNF275Q9NSD4 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ZNF275Q9NSD4 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF275Q9NSD4 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF275Q9NSD4 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF275Q9NSD4 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF275Q9NSD4 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF275Q9NSD4 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF275Q9NSD4 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF275Q9NSD4 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF275Q9NSD4 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF275Q9NSD4 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF275Q9NSD4 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF275Q9NSD4 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF275Q9NSD4 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF275Q9NSD4 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF275Q9NSD4 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF275Q9NSD4 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF275Q9NSD4 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF275Q9NSD4 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF275Q9NSD4 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF275Q9NSD4 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF275Q9NSD4 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF275Q9NSD4 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF275Q9NSD4 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF275Q9NSD4 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF275Q9NSD4 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF275Q9NSD4 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF275Q9NSD4 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF275Q9NSD4 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF275Q9NSD4 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF275Q9NSD4 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF275Q9NSD4 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF275Q9NSD4 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF275Q9NSD4 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF275Q9NSD4 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF275Q9NSD4 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF275Q9NSD4 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF275Q9NSD4 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF275Q9NSD4 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF275Q9NSD4 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF275Q9NSD4 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF275Q9NSD4 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF275Q9NSD4 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF275Q9NSD4 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF275Q9NSD4 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF275Q9NSD4 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF275Q9NSD4 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF275Q9NSD4 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF275Q9NSD4 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF275Q9NSD4 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF275Q9NSD4 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF275Q9NSD4 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF275Q9NSD4 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF275Q9NSD4 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF275Q9NSD4 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF275Q9NSD4 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF275Q9NSD4 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF275Q9NSD4 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF275Q9NSD4 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF275Q9NSD4 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF275Q9NSD4 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF275Q9NSD4 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF275Q9NSD4 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF275Q9NSD4 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF275Q9NSD4 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF275Q9NSD4 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF275Q9NSD4 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms