Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS93

TM7SF3, Transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3Q9NS93 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TM7SF3Q9NS93 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TM7SF3Q9NS93 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TM7SF3Q9NS93 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TM7SF3Q9NS93 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TM7SF3Q9NS93 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TM7SF3Q9NS93 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TM7SF3Q9NS93 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TM7SF3Q9NS93 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TM7SF3Q9NS93 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TM7SF3Q9NS93 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TM7SF3Q9NS93 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TM7SF3Q9NS93 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TM7SF3Q9NS93 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TM7SF3Q9NS93 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TM7SF3Q9NS93 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TM7SF3Q9NS93 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TM7SF3Q9NS93 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TM7SF3Q9NS93 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TM7SF3Q9NS93 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TM7SF3Q9NS93 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TM7SF3Q9NS93 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TM7SF3Q9NS93 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TM7SF3Q9NS93 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TM7SF3Q9NS93 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TM7SF3Q9NS93 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TM7SF3Q9NS93 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TM7SF3Q9NS93 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TM7SF3Q9NS93 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TM7SF3Q9NS93 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TM7SF3Q9NS93 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TM7SF3Q9NS93 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TM7SF3Q9NS93 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TM7SF3Q9NS93 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TM7SF3Q9NS93 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TM7SF3Q9NS93 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TM7SF3Q9NS93 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TM7SF3Q9NS93 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TM7SF3Q9NS93 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TM7SF3Q9NS93 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TM7SF3Q9NS93 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TM7SF3Q9NS93 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TM7SF3Q9NS93 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TM7SF3Q9NS93 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TM7SF3Q9NS93 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TM7SF3Q9NS93 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TM7SF3Q9NS93 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TM7SF3Q9NS93 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TM7SF3Q9NS93 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TM7SF3Q9NS93 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TM7SF3Q9NS93 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TM7SF3Q9NS93 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TM7SF3Q9NS93 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TM7SF3Q9NS93 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TM7SF3Q9NS93 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TM7SF3Q9NS93 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TM7SF3Q9NS93 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TM7SF3Q9NS93 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TM7SF3Q9NS93 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TM7SF3Q9NS93 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TM7SF3Q9NS93 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TM7SF3Q9NS93 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TM7SF3Q9NS93 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TM7SF3Q9NS93 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TM7SF3Q9NS93 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TM7SF3Q9NS93 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TM7SF3Q9NS93 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TM7SF3Q9NS93 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TM7SF3Q9NS93 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TM7SF3Q9NS93 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TM7SF3Q9NS93 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TM7SF3Q9NS93 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TM7SF3Q9NS93 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TM7SF3Q9NS93 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TM7SF3Q9NS93 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TM7SF3Q9NS93 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TM7SF3Q9NS93 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TM7SF3Q9NS93 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TM7SF3Q9NS93 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TM7SF3Q9NS93 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TM7SF3Q9NS93 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TM7SF3Q9NS93 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TM7SF3Q9NS93 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TM7SF3Q9NS93 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TM7SF3Q9NS93 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TM7SF3Q9NS93 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TM7SF3Q9NS93 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TM7SF3Q9NS93 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TM7SF3Q9NS93 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TM7SF3Q9NS93 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TM7SF3Q9NS93 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TM7SF3Q9NS93 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TM7SF3Q9NS93 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TM7SF3Q9NS93 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TM7SF3Q9NS93 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TM7SF3Q9NS93 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TM7SF3Q9NS93 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TM7SF3Q9NS93 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TM7SF3Q9NS93 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TM7SF3Q9NS93 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms