Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS15

LTBP3, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP3Q9NS15 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
LTBP3Q9NS15 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LTBP3Q9NS15 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC22■■□□□ 1.11
LTBP3Q9NS15 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LTBP3Q9NS15 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LTBP3Q9NS15 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LTBP3Q9NS15 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LTBP3Q9NS15 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LTBP3Q9NS15 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LTBP3Q9NS15 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LTBP3Q9NS15 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LTBP3Q9NS15 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
LTBP3Q9NS15 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
LTBP3Q9NS15 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LTBP3Q9NS15 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LTBP3Q9NS15 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LTBP3Q9NS15 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LTBP3Q9NS15 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
LTBP3Q9NS15 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LTBP3Q9NS15 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LTBP3Q9NS15 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LTBP3Q9NS15 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LTBP3Q9NS15 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LTBP3Q9NS15 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
LTBP3Q9NS15 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LTBP3Q9NS15 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LTBP3Q9NS15 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LTBP3Q9NS15 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LTBP3Q9NS15 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LTBP3Q9NS15 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LTBP3Q9NS15 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LTBP3Q9NS15 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LTBP3Q9NS15 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LTBP3Q9NS15 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
LTBP3Q9NS15 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
LTBP3Q9NS15 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LTBP3Q9NS15 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LTBP3Q9NS15 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LTBP3Q9NS15 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LTBP3Q9NS15 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LTBP3Q9NS15 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LTBP3Q9NS15 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LTBP3Q9NS15 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LTBP3Q9NS15 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LTBP3Q9NS15 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LTBP3Q9NS15 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LTBP3Q9NS15 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LTBP3Q9NS15 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LTBP3Q9NS15 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LTBP3Q9NS15 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LTBP3Q9NS15 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LTBP3Q9NS15 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LTBP3Q9NS15 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LTBP3Q9NS15 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LTBP3Q9NS15 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
LTBP3Q9NS15 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LTBP3Q9NS15 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
LTBP3Q9NS15 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LTBP3Q9NS15 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
LTBP3Q9NS15 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LTBP3Q9NS15 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
LTBP3Q9NS15 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
LTBP3Q9NS15 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LTBP3Q9NS15 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LTBP3Q9NS15 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
LTBP3Q9NS15 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LTBP3Q9NS15 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LTBP3Q9NS15 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LTBP3Q9NS15 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LTBP3Q9NS15 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LTBP3Q9NS15 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LTBP3Q9NS15 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LTBP3Q9NS15 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LTBP3Q9NS15 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LTBP3Q9NS15 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LTBP3Q9NS15 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LTBP3Q9NS15 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LTBP3Q9NS15 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LTBP3Q9NS15 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LTBP3Q9NS15 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LTBP3Q9NS15 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LTBP3Q9NS15 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LTBP3Q9NS15 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LTBP3Q9NS15 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LTBP3Q9NS15 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LTBP3Q9NS15 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LTBP3Q9NS15 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LTBP3Q9NS15 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LTBP3Q9NS15 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LTBP3Q9NS15 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LTBP3Q9NS15 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LTBP3Q9NS15 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LTBP3Q9NS15 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
LTBP3Q9NS15 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LTBP3Q9NS15 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LTBP3Q9NS15 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LTBP3Q9NS15 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LTBP3Q9NS15 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LTBP3Q9NS15 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LTBP3Q9NS15 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
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