Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR5

UBQLN4, Ubiquilin-4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBQLN4Q9NRR5 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
UBQLN4Q9NRR5 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
UBQLN4Q9NRR5 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
UBQLN4Q9NRR5 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
UBQLN4Q9NRR5 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
UBQLN4Q9NRR5 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
UBQLN4Q9NRR5 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
UBQLN4Q9NRR5 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
UBQLN4Q9NRR5 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
UBQLN4Q9NRR5 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
UBQLN4Q9NRR5 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
UBQLN4Q9NRR5 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
UBQLN4Q9NRR5 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
UBQLN4Q9NRR5 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
UBQLN4Q9NRR5 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
UBQLN4Q9NRR5 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
UBQLN4Q9NRR5 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
UBQLN4Q9NRR5 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
UBQLN4Q9NRR5 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
UBQLN4Q9NRR5 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
UBQLN4Q9NRR5 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
UBQLN4Q9NRR5 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
UBQLN4Q9NRR5 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
UBQLN4Q9NRR5 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
UBQLN4Q9NRR5 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
UBQLN4Q9NRR5 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
UBQLN4Q9NRR5 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
UBQLN4Q9NRR5 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
UBQLN4Q9NRR5 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
UBQLN4Q9NRR5 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
UBQLN4Q9NRR5 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
UBQLN4Q9NRR5 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
UBQLN4Q9NRR5 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
UBQLN4Q9NRR5 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
UBQLN4Q9NRR5 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
UBQLN4Q9NRR5 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
UBQLN4Q9NRR5 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
UBQLN4Q9NRR5 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
UBQLN4Q9NRR5 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
UBQLN4Q9NRR5 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
UBQLN4Q9NRR5 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
UBQLN4Q9NRR5 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
UBQLN4Q9NRR5 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
UBQLN4Q9NRR5 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
UBQLN4Q9NRR5 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
UBQLN4Q9NRR5 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
UBQLN4Q9NRR5 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
UBQLN4Q9NRR5 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
UBQLN4Q9NRR5 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
UBQLN4Q9NRR5 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
UBQLN4Q9NRR5 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBQLN4Q9NRR5 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBQLN4Q9NRR5 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBQLN4Q9NRR5 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBQLN4Q9NRR5 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBQLN4Q9NRR5 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBQLN4Q9NRR5 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBQLN4Q9NRR5 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBQLN4Q9NRR5 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBQLN4Q9NRR5 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBQLN4Q9NRR5 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
UBQLN4Q9NRR5 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBQLN4Q9NRR5 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBQLN4Q9NRR5 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBQLN4Q9NRR5 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBQLN4Q9NRR5 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBQLN4Q9NRR5 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBQLN4Q9NRR5 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
UBQLN4Q9NRR5 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBQLN4Q9NRR5 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBQLN4Q9NRR5 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBQLN4Q9NRR5 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBQLN4Q9NRR5 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBQLN4Q9NRR5 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBQLN4Q9NRR5 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
UBQLN4Q9NRR5 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBQLN4Q9NRR5 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBQLN4Q9NRR5 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBQLN4Q9NRR5 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBQLN4Q9NRR5 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBQLN4Q9NRR5 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
UBQLN4Q9NRR5 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBQLN4Q9NRR5 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBQLN4Q9NRR5 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBQLN4Q9NRR5 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBQLN4Q9NRR5 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
UBQLN4Q9NRR5 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBQLN4Q9NRR5 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBQLN4Q9NRR5 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBQLN4Q9NRR5 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBQLN4Q9NRR5 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBQLN4Q9NRR5 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBQLN4Q9NRR5 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBQLN4Q9NRR5 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBQLN4Q9NRR5 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBQLN4Q9NRR5 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBQLN4Q9NRR5 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBQLN4Q9NRR5 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBQLN4Q9NRR5 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBQLN4Q9NRR5 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms