Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQW1

SEC31B, Protein transport protein Sec31B, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC31BQ9NQW1 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEC31BQ9NQW1 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEC31BQ9NQW1 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEC31BQ9NQW1 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SEC31BQ9NQW1 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEC31BQ9NQW1 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEC31BQ9NQW1 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEC31BQ9NQW1 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEC31BQ9NQW1 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEC31BQ9NQW1 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEC31BQ9NQW1 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEC31BQ9NQW1 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEC31BQ9NQW1 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEC31BQ9NQW1 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEC31BQ9NQW1 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEC31BQ9NQW1 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEC31BQ9NQW1 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEC31BQ9NQW1 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEC31BQ9NQW1 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEC31BQ9NQW1 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEC31BQ9NQW1 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEC31BQ9NQW1 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEC31BQ9NQW1 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEC31BQ9NQW1 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEC31BQ9NQW1 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SEC31BQ9NQW1 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEC31BQ9NQW1 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SEC31BQ9NQW1 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEC31BQ9NQW1 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SEC31BQ9NQW1 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEC31BQ9NQW1 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEC31BQ9NQW1 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEC31BQ9NQW1 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEC31BQ9NQW1 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEC31BQ9NQW1 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEC31BQ9NQW1 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEC31BQ9NQW1 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEC31BQ9NQW1 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEC31BQ9NQW1 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEC31BQ9NQW1 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEC31BQ9NQW1 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEC31BQ9NQW1 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEC31BQ9NQW1 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEC31BQ9NQW1 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEC31BQ9NQW1 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEC31BQ9NQW1 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEC31BQ9NQW1 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEC31BQ9NQW1 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEC31BQ9NQW1 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEC31BQ9NQW1 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SEC31BQ9NQW1 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEC31BQ9NQW1 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEC31BQ9NQW1 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEC31BQ9NQW1 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEC31BQ9NQW1 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEC31BQ9NQW1 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEC31BQ9NQW1 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEC31BQ9NQW1 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEC31BQ9NQW1 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEC31BQ9NQW1 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEC31BQ9NQW1 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEC31BQ9NQW1 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEC31BQ9NQW1 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEC31BQ9NQW1 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEC31BQ9NQW1 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEC31BQ9NQW1 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEC31BQ9NQW1 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SEC31BQ9NQW1 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEC31BQ9NQW1 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEC31BQ9NQW1 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEC31BQ9NQW1 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEC31BQ9NQW1 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEC31BQ9NQW1 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEC31BQ9NQW1 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SEC31BQ9NQW1 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEC31BQ9NQW1 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEC31BQ9NQW1 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEC31BQ9NQW1 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEC31BQ9NQW1 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEC31BQ9NQW1 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEC31BQ9NQW1 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEC31BQ9NQW1 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEC31BQ9NQW1 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEC31BQ9NQW1 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEC31BQ9NQW1 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEC31BQ9NQW1 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEC31BQ9NQW1 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEC31BQ9NQW1 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEC31BQ9NQW1 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEC31BQ9NQW1 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEC31BQ9NQW1 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEC31BQ9NQW1 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEC31BQ9NQW1 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEC31BQ9NQW1 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SEC31BQ9NQW1 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEC31BQ9NQW1 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEC31BQ9NQW1 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEC31BQ9NQW1 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEC31BQ9NQW1 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEC31BQ9NQW1 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms