Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQP4

PFDN4, Prefoldin subunit 4, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN4Q9NQP4 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PFDN4Q9NQP4 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PFDN4Q9NQP4 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PFDN4Q9NQP4 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PFDN4Q9NQP4 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PFDN4Q9NQP4 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PFDN4Q9NQP4 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PFDN4Q9NQP4 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PFDN4Q9NQP4 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PFDN4Q9NQP4 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PFDN4Q9NQP4 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PFDN4Q9NQP4 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PFDN4Q9NQP4 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PFDN4Q9NQP4 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PFDN4Q9NQP4 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PFDN4Q9NQP4 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PFDN4Q9NQP4 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PFDN4Q9NQP4 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PFDN4Q9NQP4 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PFDN4Q9NQP4 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PFDN4Q9NQP4 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PFDN4Q9NQP4 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PFDN4Q9NQP4 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PFDN4Q9NQP4 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PFDN4Q9NQP4 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PFDN4Q9NQP4 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PFDN4Q9NQP4 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PFDN4Q9NQP4 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PFDN4Q9NQP4 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PFDN4Q9NQP4 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PFDN4Q9NQP4 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PFDN4Q9NQP4 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PFDN4Q9NQP4 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PFDN4Q9NQP4 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PFDN4Q9NQP4 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PFDN4Q9NQP4 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PFDN4Q9NQP4 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PFDN4Q9NQP4 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PFDN4Q9NQP4 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PFDN4Q9NQP4 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PFDN4Q9NQP4 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PFDN4Q9NQP4 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PFDN4Q9NQP4 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PFDN4Q9NQP4 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PFDN4Q9NQP4 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PFDN4Q9NQP4 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PFDN4Q9NQP4 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PFDN4Q9NQP4 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PFDN4Q9NQP4 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PFDN4Q9NQP4 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PFDN4Q9NQP4 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PFDN4Q9NQP4 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PFDN4Q9NQP4 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PFDN4Q9NQP4 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PFDN4Q9NQP4 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PFDN4Q9NQP4 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PFDN4Q9NQP4 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PFDN4Q9NQP4 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PFDN4Q9NQP4 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PFDN4Q9NQP4 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PFDN4Q9NQP4 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PFDN4Q9NQP4 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PFDN4Q9NQP4 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PFDN4Q9NQP4 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PFDN4Q9NQP4 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PFDN4Q9NQP4 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PFDN4Q9NQP4 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PFDN4Q9NQP4 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PFDN4Q9NQP4 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PFDN4Q9NQP4 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PFDN4Q9NQP4 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PFDN4Q9NQP4 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PFDN4Q9NQP4 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PFDN4Q9NQP4 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PFDN4Q9NQP4 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
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PFDN4Q9NQP4 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PFDN4Q9NQP4 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PFDN4Q9NQP4 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PFDN4Q9NQP4 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PFDN4Q9NQP4 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PFDN4Q9NQP4 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PFDN4Q9NQP4 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PFDN4Q9NQP4 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PFDN4Q9NQP4 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PFDN4Q9NQP4 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PFDN4Q9NQP4 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PFDN4Q9NQP4 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PFDN4Q9NQP4 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PFDN4Q9NQP4 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PFDN4Q9NQP4 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PFDN4Q9NQP4 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PFDN4Q9NQP4 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PFDN4Q9NQP4 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PFDN4Q9NQP4 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PFDN4Q9NQP4 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PFDN4Q9NQP4 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PFDN4Q9NQP4 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PFDN4Q9NQP4 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PFDN4Q9NQP4 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
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