Protein–RNA interactions for Protein: Q9HDB9

ERVK-5, Endogenous retrovirus group K member 5 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-5Q9HDB9 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVK-5Q9HDB9 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVK-5Q9HDB9 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVK-5Q9HDB9 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVK-5Q9HDB9 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVK-5Q9HDB9 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVK-5Q9HDB9 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVK-5Q9HDB9 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVK-5Q9HDB9 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVK-5Q9HDB9 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVK-5Q9HDB9 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVK-5Q9HDB9 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVK-5Q9HDB9 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVK-5Q9HDB9 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVK-5Q9HDB9 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVK-5Q9HDB9 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVK-5Q9HDB9 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVK-5Q9HDB9 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVK-5Q9HDB9 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVK-5Q9HDB9 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVK-5Q9HDB9 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVK-5Q9HDB9 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVK-5Q9HDB9 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVK-5Q9HDB9 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVK-5Q9HDB9 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVK-5Q9HDB9 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVK-5Q9HDB9 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVK-5Q9HDB9 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVK-5Q9HDB9 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVK-5Q9HDB9 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVK-5Q9HDB9 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVK-5Q9HDB9 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVK-5Q9HDB9 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVK-5Q9HDB9 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVK-5Q9HDB9 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVK-5Q9HDB9 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVK-5Q9HDB9 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVK-5Q9HDB9 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVK-5Q9HDB9 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVK-5Q9HDB9 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVK-5Q9HDB9 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVK-5Q9HDB9 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVK-5Q9HDB9 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVK-5Q9HDB9 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVK-5Q9HDB9 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVK-5Q9HDB9 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVK-5Q9HDB9 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVK-5Q9HDB9 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVK-5Q9HDB9 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVK-5Q9HDB9 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVK-5Q9HDB9 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVK-5Q9HDB9 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVK-5Q9HDB9 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVK-5Q9HDB9 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVK-5Q9HDB9 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVK-5Q9HDB9 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVK-5Q9HDB9 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVK-5Q9HDB9 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVK-5Q9HDB9 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVK-5Q9HDB9 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVK-5Q9HDB9 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVK-5Q9HDB9 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVK-5Q9HDB9 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVK-5Q9HDB9 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVK-5Q9HDB9 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVK-5Q9HDB9 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVK-5Q9HDB9 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVK-5Q9HDB9 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVK-5Q9HDB9 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVK-5Q9HDB9 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVK-5Q9HDB9 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVK-5Q9HDB9 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVK-5Q9HDB9 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVK-5Q9HDB9 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVK-5Q9HDB9 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVK-5Q9HDB9 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVK-5Q9HDB9 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVK-5Q9HDB9 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVK-5Q9HDB9 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVK-5Q9HDB9 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVK-5Q9HDB9 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVK-5Q9HDB9 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVK-5Q9HDB9 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVK-5Q9HDB9 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVK-5Q9HDB9 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVK-5Q9HDB9 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVK-5Q9HDB9 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVK-5Q9HDB9 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVK-5Q9HDB9 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVK-5Q9HDB9 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVK-5Q9HDB9 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVK-5Q9HDB9 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVK-5Q9HDB9 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVK-5Q9HDB9 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVK-5Q9HDB9 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVK-5Q9HDB9 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVK-5Q9HDB9 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVK-5Q9HDB9 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVK-5Q9HDB9 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVK-5Q9HDB9 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms