Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC77

CENPJ, Centromere protein J, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPJQ9HC77 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CENPJQ9HC77 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CENPJQ9HC77 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CENPJQ9HC77 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CENPJQ9HC77 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CENPJQ9HC77 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CENPJQ9HC77 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CENPJQ9HC77 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CENPJQ9HC77 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CENPJQ9HC77 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CENPJQ9HC77 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CENPJQ9HC77 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CENPJQ9HC77 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CENPJQ9HC77 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CENPJQ9HC77 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CENPJQ9HC77 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CENPJQ9HC77 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CENPJQ9HC77 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CENPJQ9HC77 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CENPJQ9HC77 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CENPJQ9HC77 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CENPJQ9HC77 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CENPJQ9HC77 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CENPJQ9HC77 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CENPJQ9HC77 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CENPJQ9HC77 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CENPJQ9HC77 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CENPJQ9HC77 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CENPJQ9HC77 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CENPJQ9HC77 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CENPJQ9HC77 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CENPJQ9HC77 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CENPJQ9HC77 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CENPJQ9HC77 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CENPJQ9HC77 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CENPJQ9HC77 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CENPJQ9HC77 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CENPJQ9HC77 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CENPJQ9HC77 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CENPJQ9HC77 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CENPJQ9HC77 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CENPJQ9HC77 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CENPJQ9HC77 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CENPJQ9HC77 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CENPJQ9HC77 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CENPJQ9HC77 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CENPJQ9HC77 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CENPJQ9HC77 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CENPJQ9HC77 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CENPJQ9HC77 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CENPJQ9HC77 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CENPJQ9HC77 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CENPJQ9HC77 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CENPJQ9HC77 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CENPJQ9HC77 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CENPJQ9HC77 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CENPJQ9HC77 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CENPJQ9HC77 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CENPJQ9HC77 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CENPJQ9HC77 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CENPJQ9HC77 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CENPJQ9HC77 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CENPJQ9HC77 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CENPJQ9HC77 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CENPJQ9HC77 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CENPJQ9HC77 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CENPJQ9HC77 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CENPJQ9HC77 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CENPJQ9HC77 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CENPJQ9HC77 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CENPJQ9HC77 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CENPJQ9HC77 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CENPJQ9HC77 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CENPJQ9HC77 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CENPJQ9HC77 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CENPJQ9HC77 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CENPJQ9HC77 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CENPJQ9HC77 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CENPJQ9HC77 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CENPJQ9HC77 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CENPJQ9HC77 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CENPJQ9HC77 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CENPJQ9HC77 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CENPJQ9HC77 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CENPJQ9HC77 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CENPJQ9HC77 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CENPJQ9HC77 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CENPJQ9HC77 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CENPJQ9HC77 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CENPJQ9HC77 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CENPJQ9HC77 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CENPJQ9HC77 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CENPJQ9HC77 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CENPJQ9HC77 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CENPJQ9HC77 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CENPJQ9HC77 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CENPJQ9HC77 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CENPJQ9HC77 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CENPJQ9HC77 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CENPJQ9HC77 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms