Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBX8

LGR6, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 6, humanhuman

Predictions only

Length 967 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGR6Q9HBX8 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LGR6Q9HBX8 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LGR6Q9HBX8 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LGR6Q9HBX8 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LGR6Q9HBX8 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LGR6Q9HBX8 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LGR6Q9HBX8 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LGR6Q9HBX8 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LGR6Q9HBX8 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LGR6Q9HBX8 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LGR6Q9HBX8 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LGR6Q9HBX8 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LGR6Q9HBX8 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LGR6Q9HBX8 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LGR6Q9HBX8 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LGR6Q9HBX8 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LGR6Q9HBX8 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LGR6Q9HBX8 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LGR6Q9HBX8 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LGR6Q9HBX8 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
LGR6Q9HBX8 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LGR6Q9HBX8 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LGR6Q9HBX8 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LGR6Q9HBX8 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LGR6Q9HBX8 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LGR6Q9HBX8 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LGR6Q9HBX8 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LGR6Q9HBX8 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
LGR6Q9HBX8 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LGR6Q9HBX8 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LGR6Q9HBX8 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LGR6Q9HBX8 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LGR6Q9HBX8 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LGR6Q9HBX8 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LGR6Q9HBX8 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LGR6Q9HBX8 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LGR6Q9HBX8 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LGR6Q9HBX8 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LGR6Q9HBX8 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LGR6Q9HBX8 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LGR6Q9HBX8 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LGR6Q9HBX8 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LGR6Q9HBX8 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LGR6Q9HBX8 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
LGR6Q9HBX8 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LGR6Q9HBX8 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LGR6Q9HBX8 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LGR6Q9HBX8 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LGR6Q9HBX8 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LGR6Q9HBX8 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LGR6Q9HBX8 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
LGR6Q9HBX8 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LGR6Q9HBX8 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LGR6Q9HBX8 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LGR6Q9HBX8 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LGR6Q9HBX8 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LGR6Q9HBX8 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LGR6Q9HBX8 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LGR6Q9HBX8 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LGR6Q9HBX8 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LGR6Q9HBX8 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LGR6Q9HBX8 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LGR6Q9HBX8 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LGR6Q9HBX8 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LGR6Q9HBX8 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LGR6Q9HBX8 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LGR6Q9HBX8 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
LGR6Q9HBX8 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LGR6Q9HBX8 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
LGR6Q9HBX8 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LGR6Q9HBX8 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LGR6Q9HBX8 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LGR6Q9HBX8 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LGR6Q9HBX8 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LGR6Q9HBX8 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LGR6Q9HBX8 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LGR6Q9HBX8 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LGR6Q9HBX8 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LGR6Q9HBX8 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LGR6Q9HBX8 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LGR6Q9HBX8 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LGR6Q9HBX8 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LGR6Q9HBX8 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LGR6Q9HBX8 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LGR6Q9HBX8 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LGR6Q9HBX8 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LGR6Q9HBX8 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LGR6Q9HBX8 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LGR6Q9HBX8 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LGR6Q9HBX8 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LGR6Q9HBX8 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LGR6Q9HBX8 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LGR6Q9HBX8 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LGR6Q9HBX8 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LGR6Q9HBX8 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LGR6Q9HBX8 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LGR6Q9HBX8 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LGR6Q9HBX8 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
LGR6Q9HBX8 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
LGR6Q9HBX8 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms