Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6B4

CLMP, CXADR-like membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMPQ9H6B4 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLMPQ9H6B4 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLMPQ9H6B4 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLMPQ9H6B4 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLMPQ9H6B4 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CLMPQ9H6B4 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLMPQ9H6B4 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLMPQ9H6B4 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CLMPQ9H6B4 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CLMPQ9H6B4 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CLMPQ9H6B4 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CLMPQ9H6B4 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CLMPQ9H6B4 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CLMPQ9H6B4 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CLMPQ9H6B4 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CLMPQ9H6B4 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CLMPQ9H6B4 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CLMPQ9H6B4 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CLMPQ9H6B4 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CLMPQ9H6B4 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CLMPQ9H6B4 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CLMPQ9H6B4 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CLMPQ9H6B4 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLMPQ9H6B4 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLMPQ9H6B4 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CLMPQ9H6B4 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLMPQ9H6B4 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLMPQ9H6B4 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CLMPQ9H6B4 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLMPQ9H6B4 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CLMPQ9H6B4 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLMPQ9H6B4 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLMPQ9H6B4 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLMPQ9H6B4 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLMPQ9H6B4 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLMPQ9H6B4 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLMPQ9H6B4 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLMPQ9H6B4 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLMPQ9H6B4 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLMPQ9H6B4 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLMPQ9H6B4 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLMPQ9H6B4 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLMPQ9H6B4 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLMPQ9H6B4 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLMPQ9H6B4 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLMPQ9H6B4 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLMPQ9H6B4 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLMPQ9H6B4 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLMPQ9H6B4 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLMPQ9H6B4 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLMPQ9H6B4 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLMPQ9H6B4 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLMPQ9H6B4 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CLMPQ9H6B4 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLMPQ9H6B4 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLMPQ9H6B4 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLMPQ9H6B4 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLMPQ9H6B4 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLMPQ9H6B4 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLMPQ9H6B4 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLMPQ9H6B4 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLMPQ9H6B4 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLMPQ9H6B4 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLMPQ9H6B4 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLMPQ9H6B4 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLMPQ9H6B4 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLMPQ9H6B4 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLMPQ9H6B4 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CLMPQ9H6B4 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CLMPQ9H6B4 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CLMPQ9H6B4 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLMPQ9H6B4 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLMPQ9H6B4 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLMPQ9H6B4 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLMPQ9H6B4 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLMPQ9H6B4 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLMPQ9H6B4 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLMPQ9H6B4 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLMPQ9H6B4 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLMPQ9H6B4 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLMPQ9H6B4 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLMPQ9H6B4 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLMPQ9H6B4 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLMPQ9H6B4 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLMPQ9H6B4 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLMPQ9H6B4 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLMPQ9H6B4 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLMPQ9H6B4 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLMPQ9H6B4 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLMPQ9H6B4 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLMPQ9H6B4 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLMPQ9H6B4 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLMPQ9H6B4 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLMPQ9H6B4 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLMPQ9H6B4 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CLMPQ9H6B4 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CLMPQ9H6B4 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLMPQ9H6B4 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLMPQ9H6B4 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CLMPQ9H6B4 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms