Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2J4

PDCL3, Phosducin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL3Q9H2J4 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDCL3Q9H2J4 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDCL3Q9H2J4 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDCL3Q9H2J4 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDCL3Q9H2J4 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDCL3Q9H2J4 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDCL3Q9H2J4 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDCL3Q9H2J4 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDCL3Q9H2J4 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDCL3Q9H2J4 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDCL3Q9H2J4 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDCL3Q9H2J4 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDCL3Q9H2J4 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDCL3Q9H2J4 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDCL3Q9H2J4 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDCL3Q9H2J4 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDCL3Q9H2J4 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDCL3Q9H2J4 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDCL3Q9H2J4 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDCL3Q9H2J4 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDCL3Q9H2J4 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDCL3Q9H2J4 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDCL3Q9H2J4 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDCL3Q9H2J4 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDCL3Q9H2J4 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDCL3Q9H2J4 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDCL3Q9H2J4 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDCL3Q9H2J4 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDCL3Q9H2J4 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDCL3Q9H2J4 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDCL3Q9H2J4 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDCL3Q9H2J4 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDCL3Q9H2J4 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDCL3Q9H2J4 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDCL3Q9H2J4 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDCL3Q9H2J4 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDCL3Q9H2J4 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDCL3Q9H2J4 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDCL3Q9H2J4 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDCL3Q9H2J4 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDCL3Q9H2J4 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDCL3Q9H2J4 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDCL3Q9H2J4 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDCL3Q9H2J4 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDCL3Q9H2J4 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDCL3Q9H2J4 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDCL3Q9H2J4 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDCL3Q9H2J4 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDCL3Q9H2J4 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDCL3Q9H2J4 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDCL3Q9H2J4 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDCL3Q9H2J4 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PDCL3Q9H2J4 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDCL3Q9H2J4 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDCL3Q9H2J4 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDCL3Q9H2J4 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDCL3Q9H2J4 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDCL3Q9H2J4 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDCL3Q9H2J4 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDCL3Q9H2J4 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDCL3Q9H2J4 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDCL3Q9H2J4 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDCL3Q9H2J4 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDCL3Q9H2J4 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDCL3Q9H2J4 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDCL3Q9H2J4 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDCL3Q9H2J4 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDCL3Q9H2J4 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDCL3Q9H2J4 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDCL3Q9H2J4 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDCL3Q9H2J4 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDCL3Q9H2J4 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDCL3Q9H2J4 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDCL3Q9H2J4 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDCL3Q9H2J4 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDCL3Q9H2J4 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDCL3Q9H2J4 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDCL3Q9H2J4 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDCL3Q9H2J4 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDCL3Q9H2J4 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDCL3Q9H2J4 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDCL3Q9H2J4 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDCL3Q9H2J4 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PDCL3Q9H2J4 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDCL3Q9H2J4 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PDCL3Q9H2J4 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDCL3Q9H2J4 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDCL3Q9H2J4 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDCL3Q9H2J4 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDCL3Q9H2J4 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDCL3Q9H2J4 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDCL3Q9H2J4 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDCL3Q9H2J4 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDCL3Q9H2J4 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDCL3Q9H2J4 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDCL3Q9H2J4 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDCL3Q9H2J4 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDCL3Q9H2J4 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDCL3Q9H2J4 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDCL3Q9H2J4 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms