Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU5

NYX, Nyctalopin, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NYXQ9GZU5 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NYXQ9GZU5 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NYXQ9GZU5 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NYXQ9GZU5 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NYXQ9GZU5 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NYXQ9GZU5 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NYXQ9GZU5 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NYXQ9GZU5 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NYXQ9GZU5 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NYXQ9GZU5 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NYXQ9GZU5 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NYXQ9GZU5 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NYXQ9GZU5 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NYXQ9GZU5 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NYXQ9GZU5 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NYXQ9GZU5 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NYXQ9GZU5 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NYXQ9GZU5 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NYXQ9GZU5 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NYXQ9GZU5 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NYXQ9GZU5 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NYXQ9GZU5 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NYXQ9GZU5 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NYXQ9GZU5 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NYXQ9GZU5 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NYXQ9GZU5 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NYXQ9GZU5 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NYXQ9GZU5 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NYXQ9GZU5 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NYXQ9GZU5 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NYXQ9GZU5 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
NYXQ9GZU5 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NYXQ9GZU5 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.23
NYXQ9GZU5 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NYXQ9GZU5 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NYXQ9GZU5 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NYXQ9GZU5 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NYXQ9GZU5 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NYXQ9GZU5 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NYXQ9GZU5 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NYXQ9GZU5 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NYXQ9GZU5 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NYXQ9GZU5 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NYXQ9GZU5 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NYXQ9GZU5 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NYXQ9GZU5 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NYXQ9GZU5 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NYXQ9GZU5 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NYXQ9GZU5 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NYXQ9GZU5 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NYXQ9GZU5 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NYXQ9GZU5 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NYXQ9GZU5 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NYXQ9GZU5 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NYXQ9GZU5 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NYXQ9GZU5 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NYXQ9GZU5 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NYXQ9GZU5 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NYXQ9GZU5 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NYXQ9GZU5 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NYXQ9GZU5 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NYXQ9GZU5 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NYXQ9GZU5 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NYXQ9GZU5 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NYXQ9GZU5 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NYXQ9GZU5 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NYXQ9GZU5 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NYXQ9GZU5 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NYXQ9GZU5 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NYXQ9GZU5 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NYXQ9GZU5 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NYXQ9GZU5 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NYXQ9GZU5 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NYXQ9GZU5 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NYXQ9GZU5 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NYXQ9GZU5 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NYXQ9GZU5 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NYXQ9GZU5 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NYXQ9GZU5 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NYXQ9GZU5 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NYXQ9GZU5 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NYXQ9GZU5 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NYXQ9GZU5 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NYXQ9GZU5 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NYXQ9GZU5 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NYXQ9GZU5 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NYXQ9GZU5 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NYXQ9GZU5 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NYXQ9GZU5 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NYXQ9GZU5 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NYXQ9GZU5 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NYXQ9GZU5 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NYXQ9GZU5 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NYXQ9GZU5 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NYXQ9GZU5 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NYXQ9GZU5 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NYXQ9GZU5 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NYXQ9GZU5 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NYXQ9GZU5 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NYXQ9GZU5 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms