Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL4Q9C0H6 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL4Q9C0H6 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL4Q9C0H6 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL4Q9C0H6 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL4Q9C0H6 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL4Q9C0H6 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL4Q9C0H6 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL4Q9C0H6 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL4Q9C0H6 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL4Q9C0H6 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL4Q9C0H6 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL4Q9C0H6 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL4Q9C0H6 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL4Q9C0H6 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL4Q9C0H6 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL4Q9C0H6 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL4Q9C0H6 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL4Q9C0H6 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL4Q9C0H6 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL4Q9C0H6 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms