Protein–RNA interactions for Protein: Q9C035

TRIM5, Tripartite motif-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM5Q9C035 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM5Q9C035 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM5Q9C035 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM5Q9C035 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM5Q9C035 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM5Q9C035 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM5Q9C035 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM5Q9C035 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM5Q9C035 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM5Q9C035 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM5Q9C035 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM5Q9C035 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM5Q9C035 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM5Q9C035 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM5Q9C035 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM5Q9C035 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM5Q9C035 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM5Q9C035 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM5Q9C035 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM5Q9C035 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM5Q9C035 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM5Q9C035 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM5Q9C035 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM5Q9C035 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM5Q9C035 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM5Q9C035 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM5Q9C035 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM5Q9C035 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM5Q9C035 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM5Q9C035 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM5Q9C035 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM5Q9C035 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM5Q9C035 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM5Q9C035 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM5Q9C035 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM5Q9C035 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM5Q9C035 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM5Q9C035 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM5Q9C035 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM5Q9C035 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM5Q9C035 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM5Q9C035 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM5Q9C035 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM5Q9C035 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM5Q9C035 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM5Q9C035 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM5Q9C035 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM5Q9C035 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM5Q9C035 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM5Q9C035 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM5Q9C035 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM5Q9C035 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM5Q9C035 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM5Q9C035 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM5Q9C035 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM5Q9C035 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM5Q9C035 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM5Q9C035 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM5Q9C035 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM5Q9C035 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM5Q9C035 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM5Q9C035 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM5Q9C035 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM5Q9C035 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM5Q9C035 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM5Q9C035 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM5Q9C035 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM5Q9C035 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM5Q9C035 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM5Q9C035 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM5Q9C035 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM5Q9C035 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM5Q9C035 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM5Q9C035 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM5Q9C035 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM5Q9C035 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM5Q9C035 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM5Q9C035 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM5Q9C035 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM5Q9C035 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM5Q9C035 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM5Q9C035 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM5Q9C035 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM5Q9C035 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM5Q9C035 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM5Q9C035 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM5Q9C035 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM5Q9C035 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM5Q9C035 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM5Q9C035 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM5Q9C035 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM5Q9C035 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM5Q9C035 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM5Q9C035 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM5Q9C035 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM5Q9C035 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM5Q9C035 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM5Q9C035 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM5Q9C035 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM5Q9C035 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms