Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW2

SLC13A1, Solute carrier family 13 member 1, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC13A1Q9BZW2 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC13A1Q9BZW2 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC13A1Q9BZW2 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC13A1Q9BZW2 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC13A1Q9BZW2 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC13A1Q9BZW2 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC13A1Q9BZW2 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC13A1Q9BZW2 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC13A1Q9BZW2 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC13A1Q9BZW2 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC13A1Q9BZW2 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC13A1Q9BZW2 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC13A1Q9BZW2 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC13A1Q9BZW2 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC13A1Q9BZW2 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC13A1Q9BZW2 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC13A1Q9BZW2 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC13A1Q9BZW2 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC13A1Q9BZW2 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC13A1Q9BZW2 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC13A1Q9BZW2 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC13A1Q9BZW2 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC13A1Q9BZW2 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC13A1Q9BZW2 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC13A1Q9BZW2 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC13A1Q9BZW2 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC13A1Q9BZW2 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC13A1Q9BZW2 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC13A1Q9BZW2 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC13A1Q9BZW2 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC13A1Q9BZW2 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC13A1Q9BZW2 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC13A1Q9BZW2 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC13A1Q9BZW2 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC13A1Q9BZW2 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC13A1Q9BZW2 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC13A1Q9BZW2 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC13A1Q9BZW2 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC13A1Q9BZW2 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC13A1Q9BZW2 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC13A1Q9BZW2 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC13A1Q9BZW2 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC13A1Q9BZW2 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC13A1Q9BZW2 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC13A1Q9BZW2 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC13A1Q9BZW2 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC13A1Q9BZW2 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC13A1Q9BZW2 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC13A1Q9BZW2 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC13A1Q9BZW2 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC13A1Q9BZW2 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC13A1Q9BZW2 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC13A1Q9BZW2 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC13A1Q9BZW2 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC13A1Q9BZW2 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC13A1Q9BZW2 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC13A1Q9BZW2 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC13A1Q9BZW2 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC13A1Q9BZW2 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC13A1Q9BZW2 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC13A1Q9BZW2 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC13A1Q9BZW2 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC13A1Q9BZW2 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC13A1Q9BZW2 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC13A1Q9BZW2 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC13A1Q9BZW2 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC13A1Q9BZW2 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC13A1Q9BZW2 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC13A1Q9BZW2 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SLC13A1Q9BZW2 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SLC13A1Q9BZW2 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SLC13A1Q9BZW2 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SLC13A1Q9BZW2 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SLC13A1Q9BZW2 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SLC13A1Q9BZW2 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SLC13A1Q9BZW2 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SLC13A1Q9BZW2 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SLC13A1Q9BZW2 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
SLC13A1Q9BZW2 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SLC13A1Q9BZW2 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SLC13A1Q9BZW2 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
SLC13A1Q9BZW2 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
SLC13A1Q9BZW2 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SLC13A1Q9BZW2 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SLC13A1Q9BZW2 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SLC13A1Q9BZW2 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
SLC13A1Q9BZW2 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SLC13A1Q9BZW2 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SLC13A1Q9BZW2 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SLC13A1Q9BZW2 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SLC13A1Q9BZW2 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SLC13A1Q9BZW2 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SLC13A1Q9BZW2 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SLC13A1Q9BZW2 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SLC13A1Q9BZW2 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SLC13A1Q9BZW2 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SLC13A1Q9BZW2 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SLC13A1Q9BZW2 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SLC13A1Q9BZW2 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SLC13A1Q9BZW2 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms