Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZ95

NSD3, Histone-lysine N-methyltransferase NSD3, humanhuman

Predictions only

Length 1,437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSD3Q9BZ95 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NSD3Q9BZ95 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
NSD3Q9BZ95 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
NSD3Q9BZ95 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NSD3Q9BZ95 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
NSD3Q9BZ95 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NSD3Q9BZ95 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NSD3Q9BZ95 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NSD3Q9BZ95 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NSD3Q9BZ95 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NSD3Q9BZ95 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NSD3Q9BZ95 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NSD3Q9BZ95 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NSD3Q9BZ95 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
NSD3Q9BZ95 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NSD3Q9BZ95 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NSD3Q9BZ95 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NSD3Q9BZ95 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NSD3Q9BZ95 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NSD3Q9BZ95 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
NSD3Q9BZ95 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NSD3Q9BZ95 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NSD3Q9BZ95 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NSD3Q9BZ95 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NSD3Q9BZ95 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NSD3Q9BZ95 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
NSD3Q9BZ95 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NSD3Q9BZ95 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
NSD3Q9BZ95 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NSD3Q9BZ95 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NSD3Q9BZ95 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NSD3Q9BZ95 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NSD3Q9BZ95 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NSD3Q9BZ95 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NSD3Q9BZ95 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NSD3Q9BZ95 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NSD3Q9BZ95 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NSD3Q9BZ95 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NSD3Q9BZ95 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
NSD3Q9BZ95 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
NSD3Q9BZ95 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NSD3Q9BZ95 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NSD3Q9BZ95 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NSD3Q9BZ95 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
NSD3Q9BZ95 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NSD3Q9BZ95 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
NSD3Q9BZ95 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NSD3Q9BZ95 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NSD3Q9BZ95 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NSD3Q9BZ95 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NSD3Q9BZ95 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NSD3Q9BZ95 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NSD3Q9BZ95 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NSD3Q9BZ95 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NSD3Q9BZ95 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NSD3Q9BZ95 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NSD3Q9BZ95 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NSD3Q9BZ95 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NSD3Q9BZ95 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NSD3Q9BZ95 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NSD3Q9BZ95 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NSD3Q9BZ95 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NSD3Q9BZ95 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NSD3Q9BZ95 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NSD3Q9BZ95 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NSD3Q9BZ95 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NSD3Q9BZ95 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NSD3Q9BZ95 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NSD3Q9BZ95 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NSD3Q9BZ95 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NSD3Q9BZ95 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
NSD3Q9BZ95 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NSD3Q9BZ95 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NSD3Q9BZ95 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NSD3Q9BZ95 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NSD3Q9BZ95 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NSD3Q9BZ95 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NSD3Q9BZ95 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NSD3Q9BZ95 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NSD3Q9BZ95 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NSD3Q9BZ95 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NSD3Q9BZ95 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NSD3Q9BZ95 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NSD3Q9BZ95 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NSD3Q9BZ95 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NSD3Q9BZ95 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NSD3Q9BZ95 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NSD3Q9BZ95 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NSD3Q9BZ95 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NSD3Q9BZ95 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
NSD3Q9BZ95 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
NSD3Q9BZ95 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NSD3Q9BZ95 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NSD3Q9BZ95 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NSD3Q9BZ95 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NSD3Q9BZ95 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NSD3Q9BZ95 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NSD3Q9BZ95 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NSD3Q9BZ95 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NSD3Q9BZ95 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms