Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM55Q9BYV6 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM55Q9BYV6 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM55Q9BYV6 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM55Q9BYV6 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM55Q9BYV6 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM55Q9BYV6 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM55Q9BYV6 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM55Q9BYV6 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM55Q9BYV6 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM55Q9BYV6 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM55Q9BYV6 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM55Q9BYV6 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM55Q9BYV6 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM55Q9BYV6 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM55Q9BYV6 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM55Q9BYV6 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM55Q9BYV6 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM55Q9BYV6 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM55Q9BYV6 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM55Q9BYV6 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM55Q9BYV6 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM55Q9BYV6 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM55Q9BYV6 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM55Q9BYV6 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM55Q9BYV6 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM55Q9BYV6 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM55Q9BYV6 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM55Q9BYV6 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM55Q9BYV6 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM55Q9BYV6 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM55Q9BYV6 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM55Q9BYV6 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM55Q9BYV6 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM55Q9BYV6 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM55Q9BYV6 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM55Q9BYV6 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM55Q9BYV6 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM55Q9BYV6 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM55Q9BYV6 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM55Q9BYV6 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM55Q9BYV6 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM55Q9BYV6 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM55Q9BYV6 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM55Q9BYV6 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM55Q9BYV6 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM55Q9BYV6 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM55Q9BYV6 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM55Q9BYV6 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM55Q9BYV6 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM55Q9BYV6 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM55Q9BYV6 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM55Q9BYV6 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM55Q9BYV6 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM55Q9BYV6 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM55Q9BYV6 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM55Q9BYV6 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM55Q9BYV6 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM55Q9BYV6 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM55Q9BYV6 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM55Q9BYV6 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM55Q9BYV6 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM55Q9BYV6 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM55Q9BYV6 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM55Q9BYV6 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM55Q9BYV6 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM55Q9BYV6 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM55Q9BYV6 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM55Q9BYV6 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM55Q9BYV6 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM55Q9BYV6 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM55Q9BYV6 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM55Q9BYV6 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM55Q9BYV6 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM55Q9BYV6 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM55Q9BYV6 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM55Q9BYV6 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM55Q9BYV6 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM55Q9BYV6 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM55Q9BYV6 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM55Q9BYV6 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM55Q9BYV6 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM55Q9BYV6 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM55Q9BYV6 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM55Q9BYV6 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM55Q9BYV6 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM55Q9BYV6 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM55Q9BYV6 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM55Q9BYV6 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM55Q9BYV6 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM55Q9BYV6 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM55Q9BYV6 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM55Q9BYV6 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM55Q9BYV6 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM55Q9BYV6 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
TRIM55Q9BYV6 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRIM55Q9BYV6 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRIM55Q9BYV6 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRIM55Q9BYV6 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRIM55Q9BYV6 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms