Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms