Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
RNF17Q9BXT8 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
RNF17Q9BXT8 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RNF17Q9BXT8 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
RNF17Q9BXT8 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
RNF17Q9BXT8 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
RNF17Q9BXT8 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
RNF17Q9BXT8 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
RNF17Q9BXT8 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RNF17Q9BXT8 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RNF17Q9BXT8 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RNF17Q9BXT8 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RNF17Q9BXT8 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RNF17Q9BXT8 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RNF17Q9BXT8 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RNF17Q9BXT8 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RNF17Q9BXT8 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
RNF17Q9BXT8 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RNF17Q9BXT8 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RNF17Q9BXT8 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RNF17Q9BXT8 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
RNF17Q9BXT8 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
RNF17Q9BXT8 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
RNF17Q9BXT8 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RNF17Q9BXT8 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RNF17Q9BXT8 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RNF17Q9BXT8 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RNF17Q9BXT8 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RNF17Q9BXT8 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RNF17Q9BXT8 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RNF17Q9BXT8 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RNF17Q9BXT8 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RNF17Q9BXT8 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RNF17Q9BXT8 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RNF17Q9BXT8 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RNF17Q9BXT8 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RNF17Q9BXT8 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
RNF17Q9BXT8 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RNF17Q9BXT8 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RNF17Q9BXT8 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RNF17Q9BXT8 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RNF17Q9BXT8 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RNF17Q9BXT8 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RNF17Q9BXT8 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RNF17Q9BXT8 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RNF17Q9BXT8 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RNF17Q9BXT8 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RNF17Q9BXT8 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RNF17Q9BXT8 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RNF17Q9BXT8 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RNF17Q9BXT8 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RNF17Q9BXT8 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RNF17Q9BXT8 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RNF17Q9BXT8 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RNF17Q9BXT8 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RNF17Q9BXT8 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RNF17Q9BXT8 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RNF17Q9BXT8 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RNF17Q9BXT8 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RNF17Q9BXT8 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RNF17Q9BXT8 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RNF17Q9BXT8 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RNF17Q9BXT8 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RNF17Q9BXT8 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RNF17Q9BXT8 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
RNF17Q9BXT8 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RNF17Q9BXT8 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
RNF17Q9BXT8 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
RNF17Q9BXT8 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
RNF17Q9BXT8 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RNF17Q9BXT8 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RNF17Q9BXT8 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RNF17Q9BXT8 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RNF17Q9BXT8 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RNF17Q9BXT8 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RNF17Q9BXT8 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RNF17Q9BXT8 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RNF17Q9BXT8 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
RNF17Q9BXT8 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RNF17Q9BXT8 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
RNF17Q9BXT8 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RNF17Q9BXT8 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RNF17Q9BXT8 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RNF17Q9BXT8 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RNF17Q9BXT8 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RNF17Q9BXT8 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RNF17Q9BXT8 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RNF17Q9BXT8 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
RNF17Q9BXT8 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
RNF17Q9BXT8 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
RNF17Q9BXT8 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RNF17Q9BXT8 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RNF17Q9BXT8 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RNF17Q9BXT8 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RNF17Q9BXT8 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RNF17Q9BXT8 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RNF17Q9BXT8 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RNF17Q9BXT8 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
RNF17Q9BXT8 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
RNF17Q9BXT8 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms