Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF6

RAB11FIP5, Rab11 family-interacting protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP5Q9BXF6 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB11FIP5Q9BXF6 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB11FIP5Q9BXF6 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB11FIP5Q9BXF6 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB11FIP5Q9BXF6 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB11FIP5Q9BXF6 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB11FIP5Q9BXF6 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB11FIP5Q9BXF6 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB11FIP5Q9BXF6 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB11FIP5Q9BXF6 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB11FIP5Q9BXF6 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB11FIP5Q9BXF6 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB11FIP5Q9BXF6 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB11FIP5Q9BXF6 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB11FIP5Q9BXF6 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB11FIP5Q9BXF6 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB11FIP5Q9BXF6 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB11FIP5Q9BXF6 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB11FIP5Q9BXF6 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB11FIP5Q9BXF6 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB11FIP5Q9BXF6 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB11FIP5Q9BXF6 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB11FIP5Q9BXF6 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB11FIP5Q9BXF6 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB11FIP5Q9BXF6 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB11FIP5Q9BXF6 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB11FIP5Q9BXF6 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB11FIP5Q9BXF6 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB11FIP5Q9BXF6 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB11FIP5Q9BXF6 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB11FIP5Q9BXF6 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB11FIP5Q9BXF6 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB11FIP5Q9BXF6 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB11FIP5Q9BXF6 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB11FIP5Q9BXF6 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB11FIP5Q9BXF6 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB11FIP5Q9BXF6 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB11FIP5Q9BXF6 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB11FIP5Q9BXF6 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB11FIP5Q9BXF6 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB11FIP5Q9BXF6 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB11FIP5Q9BXF6 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB11FIP5Q9BXF6 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB11FIP5Q9BXF6 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB11FIP5Q9BXF6 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB11FIP5Q9BXF6 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB11FIP5Q9BXF6 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB11FIP5Q9BXF6 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB11FIP5Q9BXF6 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB11FIP5Q9BXF6 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB11FIP5Q9BXF6 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB11FIP5Q9BXF6 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB11FIP5Q9BXF6 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB11FIP5Q9BXF6 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB11FIP5Q9BXF6 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB11FIP5Q9BXF6 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB11FIP5Q9BXF6 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB11FIP5Q9BXF6 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB11FIP5Q9BXF6 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB11FIP5Q9BXF6 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB11FIP5Q9BXF6 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB11FIP5Q9BXF6 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB11FIP5Q9BXF6 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB11FIP5Q9BXF6 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB11FIP5Q9BXF6 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB11FIP5Q9BXF6 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB11FIP5Q9BXF6 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB11FIP5Q9BXF6 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB11FIP5Q9BXF6 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB11FIP5Q9BXF6 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB11FIP5Q9BXF6 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB11FIP5Q9BXF6 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB11FIP5Q9BXF6 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB11FIP5Q9BXF6 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB11FIP5Q9BXF6 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB11FIP5Q9BXF6 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB11FIP5Q9BXF6 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB11FIP5Q9BXF6 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB11FIP5Q9BXF6 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB11FIP5Q9BXF6 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB11FIP5Q9BXF6 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB11FIP5Q9BXF6 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB11FIP5Q9BXF6 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB11FIP5Q9BXF6 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB11FIP5Q9BXF6 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB11FIP5Q9BXF6 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB11FIP5Q9BXF6 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB11FIP5Q9BXF6 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB11FIP5Q9BXF6 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB11FIP5Q9BXF6 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB11FIP5Q9BXF6 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB11FIP5Q9BXF6 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB11FIP5Q9BXF6 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB11FIP5Q9BXF6 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB11FIP5Q9BXF6 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB11FIP5Q9BXF6 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms