Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BRIP1Q9BX63 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BRIP1Q9BX63 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BRIP1Q9BX63 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BRIP1Q9BX63 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
BRIP1Q9BX63 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BRIP1Q9BX63 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BRIP1Q9BX63 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BRIP1Q9BX63 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BRIP1Q9BX63 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BRIP1Q9BX63 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BRIP1Q9BX63 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BRIP1Q9BX63 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BRIP1Q9BX63 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BRIP1Q9BX63 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
BRIP1Q9BX63 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BRIP1Q9BX63 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BRIP1Q9BX63 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
BRIP1Q9BX63 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BRIP1Q9BX63 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BRIP1Q9BX63 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BRIP1Q9BX63 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
BRIP1Q9BX63 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BRIP1Q9BX63 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BRIP1Q9BX63 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BRIP1Q9BX63 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BRIP1Q9BX63 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
BRIP1Q9BX63 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BRIP1Q9BX63 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BRIP1Q9BX63 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BRIP1Q9BX63 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BRIP1Q9BX63 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BRIP1Q9BX63 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BRIP1Q9BX63 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
BRIP1Q9BX63 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BRIP1Q9BX63 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BRIP1Q9BX63 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
BRIP1Q9BX63 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BRIP1Q9BX63 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BRIP1Q9BX63 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BRIP1Q9BX63 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BRIP1Q9BX63 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BRIP1Q9BX63 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BRIP1Q9BX63 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BRIP1Q9BX63 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BRIP1Q9BX63 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BRIP1Q9BX63 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BRIP1Q9BX63 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BRIP1Q9BX63 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BRIP1Q9BX63 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BRIP1Q9BX63 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BRIP1Q9BX63 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BRIP1Q9BX63 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BRIP1Q9BX63 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BRIP1Q9BX63 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BRIP1Q9BX63 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BRIP1Q9BX63 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BRIP1Q9BX63 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BRIP1Q9BX63 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BRIP1Q9BX63 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BRIP1Q9BX63 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BRIP1Q9BX63 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BRIP1Q9BX63 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BRIP1Q9BX63 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BRIP1Q9BX63 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BRIP1Q9BX63 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BRIP1Q9BX63 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
BRIP1Q9BX63 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BRIP1Q9BX63 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BRIP1Q9BX63 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BRIP1Q9BX63 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BRIP1Q9BX63 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BRIP1Q9BX63 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BRIP1Q9BX63 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BRIP1Q9BX63 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
BRIP1Q9BX63 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
BRIP1Q9BX63 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
BRIP1Q9BX63 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
BRIP1Q9BX63 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
BRIP1Q9BX63 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BRIP1Q9BX63 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BRIP1Q9BX63 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BRIP1Q9BX63 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BRIP1Q9BX63 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BRIP1Q9BX63 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BRIP1Q9BX63 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
BRIP1Q9BX63 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BRIP1Q9BX63 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BRIP1Q9BX63 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
BRIP1Q9BX63 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BRIP1Q9BX63 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BRIP1Q9BX63 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BRIP1Q9BX63 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
BRIP1Q9BX63 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BRIP1Q9BX63 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BRIP1Q9BX63 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BRIP1Q9BX63 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BRIP1Q9BX63 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BRIP1Q9BX63 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BRIP1Q9BX63 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms