Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
SYCP2Q9BX26 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
SYCP2Q9BX26 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SYCP2Q9BX26 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SYCP2Q9BX26 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SYCP2Q9BX26 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
SYCP2Q9BX26 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SYCP2Q9BX26 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SYCP2Q9BX26 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SYCP2Q9BX26 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SYCP2Q9BX26 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SYCP2Q9BX26 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SYCP2Q9BX26 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SYCP2Q9BX26 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SYCP2Q9BX26 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SYCP2Q9BX26 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SYCP2Q9BX26 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SYCP2Q9BX26 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SYCP2Q9BX26 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SYCP2Q9BX26 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SYCP2Q9BX26 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SYCP2Q9BX26 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SYCP2Q9BX26 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SYCP2Q9BX26 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
SYCP2Q9BX26 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SYCP2Q9BX26 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SYCP2Q9BX26 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SYCP2Q9BX26 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SYCP2Q9BX26 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SYCP2Q9BX26 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SYCP2Q9BX26 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SYCP2Q9BX26 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SYCP2Q9BX26 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SYCP2Q9BX26 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SYCP2Q9BX26 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SYCP2Q9BX26 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SYCP2Q9BX26 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SYCP2Q9BX26 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SYCP2Q9BX26 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
SYCP2Q9BX26 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
SYCP2Q9BX26 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SYCP2Q9BX26 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SYCP2Q9BX26 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SYCP2Q9BX26 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SYCP2Q9BX26 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SYCP2Q9BX26 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SYCP2Q9BX26 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
SYCP2Q9BX26 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
SYCP2Q9BX26 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SYCP2Q9BX26 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SYCP2Q9BX26 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SYCP2Q9BX26 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SYCP2Q9BX26 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SYCP2Q9BX26 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SYCP2Q9BX26 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SYCP2Q9BX26 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SYCP2Q9BX26 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SYCP2Q9BX26 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SYCP2Q9BX26 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SYCP2Q9BX26 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
SYCP2Q9BX26 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SYCP2Q9BX26 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
SYCP2Q9BX26 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SYCP2Q9BX26 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
SYCP2Q9BX26 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SYCP2Q9BX26 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SYCP2Q9BX26 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
SYCP2Q9BX26 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SYCP2Q9BX26 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SYCP2Q9BX26 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SYCP2Q9BX26 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SYCP2Q9BX26 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SYCP2Q9BX26 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SYCP2Q9BX26 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SYCP2Q9BX26 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SYCP2Q9BX26 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SYCP2Q9BX26 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SYCP2Q9BX26 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SYCP2Q9BX26 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SYCP2Q9BX26 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SYCP2Q9BX26 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SYCP2Q9BX26 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SYCP2Q9BX26 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SYCP2Q9BX26 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SYCP2Q9BX26 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SYCP2Q9BX26 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SYCP2Q9BX26 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SYCP2Q9BX26 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SYCP2Q9BX26 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SYCP2Q9BX26 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SYCP2Q9BX26 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SYCP2Q9BX26 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SYCP2Q9BX26 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SYCP2Q9BX26 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SYCP2Q9BX26 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
SYCP2Q9BX26 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
SYCP2Q9BX26 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SYCP2Q9BX26 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SYCP2Q9BX26 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
SYCP2Q9BX26 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms