Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWW4

SSBP3, Single-stranded DNA-binding protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP3Q9BWW4 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSBP3Q9BWW4 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SSBP3Q9BWW4 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSBP3Q9BWW4 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSBP3Q9BWW4 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSBP3Q9BWW4 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSBP3Q9BWW4 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSBP3Q9BWW4 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSBP3Q9BWW4 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSBP3Q9BWW4 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSBP3Q9BWW4 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSBP3Q9BWW4 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSBP3Q9BWW4 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSBP3Q9BWW4 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSBP3Q9BWW4 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSBP3Q9BWW4 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSBP3Q9BWW4 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSBP3Q9BWW4 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSBP3Q9BWW4 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSBP3Q9BWW4 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSBP3Q9BWW4 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSBP3Q9BWW4 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSBP3Q9BWW4 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSBP3Q9BWW4 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSBP3Q9BWW4 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSBP3Q9BWW4 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSBP3Q9BWW4 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSBP3Q9BWW4 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSBP3Q9BWW4 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSBP3Q9BWW4 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSBP3Q9BWW4 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SSBP3Q9BWW4 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SSBP3Q9BWW4 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SSBP3Q9BWW4 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSBP3Q9BWW4 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSBP3Q9BWW4 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSBP3Q9BWW4 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSBP3Q9BWW4 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSBP3Q9BWW4 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SSBP3Q9BWW4 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSBP3Q9BWW4 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSBP3Q9BWW4 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SSBP3Q9BWW4 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSBP3Q9BWW4 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSBP3Q9BWW4 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSBP3Q9BWW4 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSBP3Q9BWW4 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSBP3Q9BWW4 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSBP3Q9BWW4 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSBP3Q9BWW4 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSBP3Q9BWW4 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSBP3Q9BWW4 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSBP3Q9BWW4 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSBP3Q9BWW4 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSBP3Q9BWW4 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSBP3Q9BWW4 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSBP3Q9BWW4 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSBP3Q9BWW4 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSBP3Q9BWW4 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSBP3Q9BWW4 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSBP3Q9BWW4 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSBP3Q9BWW4 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSBP3Q9BWW4 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSBP3Q9BWW4 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSBP3Q9BWW4 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSBP3Q9BWW4 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSBP3Q9BWW4 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSBP3Q9BWW4 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSBP3Q9BWW4 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSBP3Q9BWW4 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSBP3Q9BWW4 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSBP3Q9BWW4 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSBP3Q9BWW4 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSBP3Q9BWW4 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSBP3Q9BWW4 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSBP3Q9BWW4 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSBP3Q9BWW4 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SSBP3Q9BWW4 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSBP3Q9BWW4 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSBP3Q9BWW4 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSBP3Q9BWW4 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSBP3Q9BWW4 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSBP3Q9BWW4 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSBP3Q9BWW4 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSBP3Q9BWW4 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSBP3Q9BWW4 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSBP3Q9BWW4 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSBP3Q9BWW4 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSBP3Q9BWW4 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSBP3Q9BWW4 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SSBP3Q9BWW4 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSBP3Q9BWW4 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSBP3Q9BWW4 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSBP3Q9BWW4 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSBP3Q9BWW4 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSBP3Q9BWW4 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSBP3Q9BWW4 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSBP3Q9BWW4 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSBP3Q9BWW4 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSBP3Q9BWW4 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms