Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWE0

REPIN1, Replication initiator 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REPIN1Q9BWE0 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
REPIN1Q9BWE0 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
REPIN1Q9BWE0 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
REPIN1Q9BWE0 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
REPIN1Q9BWE0 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
REPIN1Q9BWE0 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
REPIN1Q9BWE0 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
REPIN1Q9BWE0 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
REPIN1Q9BWE0 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
REPIN1Q9BWE0 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
REPIN1Q9BWE0 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
REPIN1Q9BWE0 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
REPIN1Q9BWE0 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
REPIN1Q9BWE0 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
REPIN1Q9BWE0 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
REPIN1Q9BWE0 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
REPIN1Q9BWE0 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
REPIN1Q9BWE0 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
REPIN1Q9BWE0 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
REPIN1Q9BWE0 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
REPIN1Q9BWE0 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
REPIN1Q9BWE0 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
REPIN1Q9BWE0 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
REPIN1Q9BWE0 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
REPIN1Q9BWE0 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
REPIN1Q9BWE0 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
REPIN1Q9BWE0 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
REPIN1Q9BWE0 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
REPIN1Q9BWE0 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
REPIN1Q9BWE0 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
REPIN1Q9BWE0 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
REPIN1Q9BWE0 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
REPIN1Q9BWE0 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
REPIN1Q9BWE0 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
REPIN1Q9BWE0 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
REPIN1Q9BWE0 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
REPIN1Q9BWE0 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
REPIN1Q9BWE0 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
REPIN1Q9BWE0 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
REPIN1Q9BWE0 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
REPIN1Q9BWE0 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
REPIN1Q9BWE0 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
REPIN1Q9BWE0 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
REPIN1Q9BWE0 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
REPIN1Q9BWE0 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
REPIN1Q9BWE0 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
REPIN1Q9BWE0 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
REPIN1Q9BWE0 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
REPIN1Q9BWE0 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
REPIN1Q9BWE0 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
REPIN1Q9BWE0 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
REPIN1Q9BWE0 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
REPIN1Q9BWE0 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
REPIN1Q9BWE0 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
REPIN1Q9BWE0 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
REPIN1Q9BWE0 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
REPIN1Q9BWE0 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
REPIN1Q9BWE0 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
REPIN1Q9BWE0 AC007386.2-202ENST00000622718 1018 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
REPIN1Q9BWE0 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
REPIN1Q9BWE0 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
REPIN1Q9BWE0 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
REPIN1Q9BWE0 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
REPIN1Q9BWE0 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
REPIN1Q9BWE0 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
REPIN1Q9BWE0 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
REPIN1Q9BWE0 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
REPIN1Q9BWE0 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
REPIN1Q9BWE0 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
REPIN1Q9BWE0 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
REPIN1Q9BWE0 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
REPIN1Q9BWE0 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
REPIN1Q9BWE0 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
REPIN1Q9BWE0 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
REPIN1Q9BWE0 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
REPIN1Q9BWE0 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
REPIN1Q9BWE0 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
REPIN1Q9BWE0 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
REPIN1Q9BWE0 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
REPIN1Q9BWE0 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
REPIN1Q9BWE0 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
REPIN1Q9BWE0 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
REPIN1Q9BWE0 ATP6V1G1-201ENST00000374050 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
REPIN1Q9BWE0 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
REPIN1Q9BWE0 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
REPIN1Q9BWE0 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
REPIN1Q9BWE0 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
REPIN1Q9BWE0 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
REPIN1Q9BWE0 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
REPIN1Q9BWE0 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
REPIN1Q9BWE0 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
REPIN1Q9BWE0 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
REPIN1Q9BWE0 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
REPIN1Q9BWE0 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
REPIN1Q9BWE0 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
REPIN1Q9BWE0 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
REPIN1Q9BWE0 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
REPIN1Q9BWE0 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
REPIN1Q9BWE0 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
REPIN1Q9BWE0 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms