Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HIRIP3Q9BW71 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
HIRIP3Q9BW71 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HIRIP3Q9BW71 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
HIRIP3Q9BW71 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HIRIP3Q9BW71 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HIRIP3Q9BW71 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HIRIP3Q9BW71 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
HIRIP3Q9BW71 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HIRIP3Q9BW71 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
HIRIP3Q9BW71 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
HIRIP3Q9BW71 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HIRIP3Q9BW71 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HIRIP3Q9BW71 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HIRIP3Q9BW71 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HIRIP3Q9BW71 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HIRIP3Q9BW71 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HIRIP3Q9BW71 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HIRIP3Q9BW71 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HIRIP3Q9BW71 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HIRIP3Q9BW71 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HIRIP3Q9BW71 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
HIRIP3Q9BW71 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
HIRIP3Q9BW71 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
HIRIP3Q9BW71 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HIRIP3Q9BW71 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HIRIP3Q9BW71 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HIRIP3Q9BW71 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HIRIP3Q9BW71 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
HIRIP3Q9BW71 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
HIRIP3Q9BW71 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
HIRIP3Q9BW71 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
HIRIP3Q9BW71 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HIRIP3Q9BW71 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HIRIP3Q9BW71 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HIRIP3Q9BW71 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
HIRIP3Q9BW71 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
HIRIP3Q9BW71 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
HIRIP3Q9BW71 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
HIRIP3Q9BW71 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
HIRIP3Q9BW71 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HIRIP3Q9BW71 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
HIRIP3Q9BW71 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
HIRIP3Q9BW71 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HIRIP3Q9BW71 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HIRIP3Q9BW71 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HIRIP3Q9BW71 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC26.33■■□□□ 1.8
HIRIP3Q9BW71 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
HIRIP3Q9BW71 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC26.33■■□□□ 1.8
HIRIP3Q9BW71 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HIRIP3Q9BW71 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HIRIP3Q9BW71 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HIRIP3Q9BW71 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HIRIP3Q9BW71 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HIRIP3Q9BW71 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HIRIP3Q9BW71 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HIRIP3Q9BW71 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HIRIP3Q9BW71 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HIRIP3Q9BW71 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HIRIP3Q9BW71 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HIRIP3Q9BW71 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HIRIP3Q9BW71 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HIRIP3Q9BW71 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HIRIP3Q9BW71 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HIRIP3Q9BW71 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
HIRIP3Q9BW71 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HIRIP3Q9BW71 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HIRIP3Q9BW71 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HIRIP3Q9BW71 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
HIRIP3Q9BW71 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HIRIP3Q9BW71 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HIRIP3Q9BW71 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HIRIP3Q9BW71 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HIRIP3Q9BW71 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HIRIP3Q9BW71 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HIRIP3Q9BW71 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HIRIP3Q9BW71 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HIRIP3Q9BW71 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
HIRIP3Q9BW71 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
HIRIP3Q9BW71 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HIRIP3Q9BW71 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HIRIP3Q9BW71 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HIRIP3Q9BW71 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
HIRIP3Q9BW71 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HIRIP3Q9BW71 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
HIRIP3Q9BW71 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
HIRIP3Q9BW71 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
HIRIP3Q9BW71 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
HIRIP3Q9BW71 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HIRIP3Q9BW71 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
HIRIP3Q9BW71 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HIRIP3Q9BW71 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HIRIP3Q9BW71 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HIRIP3Q9BW71 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HIRIP3Q9BW71 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
HIRIP3Q9BW71 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HIRIP3Q9BW71 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HIRIP3Q9BW71 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HIRIP3Q9BW71 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HIRIP3Q9BW71 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms