Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTX1

NDC1, Nucleoporin NDC1, humanhuman

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDC1Q9BTX1 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
NDC1Q9BTX1 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
NDC1Q9BTX1 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NDC1Q9BTX1 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NDC1Q9BTX1 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NDC1Q9BTX1 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
NDC1Q9BTX1 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NDC1Q9BTX1 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NDC1Q9BTX1 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NDC1Q9BTX1 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NDC1Q9BTX1 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NDC1Q9BTX1 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NDC1Q9BTX1 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NDC1Q9BTX1 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NDC1Q9BTX1 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NDC1Q9BTX1 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NDC1Q9BTX1 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NDC1Q9BTX1 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NDC1Q9BTX1 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NDC1Q9BTX1 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NDC1Q9BTX1 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NDC1Q9BTX1 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NDC1Q9BTX1 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NDC1Q9BTX1 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NDC1Q9BTX1 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NDC1Q9BTX1 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NDC1Q9BTX1 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
NDC1Q9BTX1 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NDC1Q9BTX1 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NDC1Q9BTX1 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NDC1Q9BTX1 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NDC1Q9BTX1 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NDC1Q9BTX1 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NDC1Q9BTX1 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NDC1Q9BTX1 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NDC1Q9BTX1 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NDC1Q9BTX1 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NDC1Q9BTX1 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NDC1Q9BTX1 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NDC1Q9BTX1 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NDC1Q9BTX1 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NDC1Q9BTX1 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NDC1Q9BTX1 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NDC1Q9BTX1 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NDC1Q9BTX1 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NDC1Q9BTX1 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NDC1Q9BTX1 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NDC1Q9BTX1 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NDC1Q9BTX1 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NDC1Q9BTX1 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NDC1Q9BTX1 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NDC1Q9BTX1 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NDC1Q9BTX1 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NDC1Q9BTX1 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NDC1Q9BTX1 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NDC1Q9BTX1 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NDC1Q9BTX1 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NDC1Q9BTX1 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
NDC1Q9BTX1 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NDC1Q9BTX1 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NDC1Q9BTX1 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NDC1Q9BTX1 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NDC1Q9BTX1 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
NDC1Q9BTX1 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NDC1Q9BTX1 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NDC1Q9BTX1 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
NDC1Q9BTX1 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NDC1Q9BTX1 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NDC1Q9BTX1 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
NDC1Q9BTX1 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NDC1Q9BTX1 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NDC1Q9BTX1 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NDC1Q9BTX1 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NDC1Q9BTX1 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NDC1Q9BTX1 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NDC1Q9BTX1 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NDC1Q9BTX1 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NDC1Q9BTX1 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NDC1Q9BTX1 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms