Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTM1

H2AFJ, Histone H2A.J, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFJQ9BTM1 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
H2AFJQ9BTM1 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
H2AFJQ9BTM1 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
H2AFJQ9BTM1 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
H2AFJQ9BTM1 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
H2AFJQ9BTM1 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
H2AFJQ9BTM1 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
H2AFJQ9BTM1 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
H2AFJQ9BTM1 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2AFJQ9BTM1 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2AFJQ9BTM1 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2AFJQ9BTM1 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2AFJQ9BTM1 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2AFJQ9BTM1 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2AFJQ9BTM1 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2AFJQ9BTM1 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2AFJQ9BTM1 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2AFJQ9BTM1 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2AFJQ9BTM1 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2AFJQ9BTM1 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2AFJQ9BTM1 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2AFJQ9BTM1 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2AFJQ9BTM1 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2AFJQ9BTM1 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2AFJQ9BTM1 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2AFJQ9BTM1 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2AFJQ9BTM1 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2AFJQ9BTM1 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2AFJQ9BTM1 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2AFJQ9BTM1 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2AFJQ9BTM1 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2AFJQ9BTM1 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2AFJQ9BTM1 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2AFJQ9BTM1 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2AFJQ9BTM1 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
H2AFJQ9BTM1 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2AFJQ9BTM1 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2AFJQ9BTM1 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2AFJQ9BTM1 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2AFJQ9BTM1 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2AFJQ9BTM1 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2AFJQ9BTM1 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2AFJQ9BTM1 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2AFJQ9BTM1 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2AFJQ9BTM1 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2AFJQ9BTM1 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2AFJQ9BTM1 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2AFJQ9BTM1 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2AFJQ9BTM1 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2AFJQ9BTM1 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2AFJQ9BTM1 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2AFJQ9BTM1 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2AFJQ9BTM1 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
H2AFJQ9BTM1 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2AFJQ9BTM1 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
H2AFJQ9BTM1 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2AFJQ9BTM1 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
H2AFJQ9BTM1 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
H2AFJQ9BTM1 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
H2AFJQ9BTM1 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
H2AFJQ9BTM1 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2AFJQ9BTM1 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2AFJQ9BTM1 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2AFJQ9BTM1 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
H2AFJQ9BTM1 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
H2AFJQ9BTM1 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC18■□□□□ 0.47
H2AFJQ9BTM1 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2AFJQ9BTM1 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2AFJQ9BTM1 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
H2AFJQ9BTM1 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2AFJQ9BTM1 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2AFJQ9BTM1 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC18■□□□□ 0.47
H2AFJQ9BTM1 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2AFJQ9BTM1 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
H2AFJQ9BTM1 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2AFJQ9BTM1 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2AFJQ9BTM1 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
H2AFJQ9BTM1 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
H2AFJQ9BTM1 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2AFJQ9BTM1 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2AFJQ9BTM1 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18■□□□□ 0.47
H2AFJQ9BTM1 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2AFJQ9BTM1 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
H2AFJQ9BTM1 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2AFJQ9BTM1 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2AFJQ9BTM1 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2AFJQ9BTM1 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2AFJQ9BTM1 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2AFJQ9BTM1 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2AFJQ9BTM1 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2AFJQ9BTM1 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2AFJQ9BTM1 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2AFJQ9BTM1 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2AFJQ9BTM1 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2AFJQ9BTM1 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
H2AFJQ9BTM1 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2AFJQ9BTM1 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2AFJQ9BTM1 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
H2AFJQ9BTM1 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2AFJQ9BTM1 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms