Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSM1

PCGF1, Polycomb group RING finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF1Q9BSM1 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCGF1Q9BSM1 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms