Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSI4

TINF2, TERF1-interacting nuclear factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TINF2Q9BSI4 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TINF2Q9BSI4 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TINF2Q9BSI4 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TINF2Q9BSI4 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TINF2Q9BSI4 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TINF2Q9BSI4 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
TINF2Q9BSI4 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TINF2Q9BSI4 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TINF2Q9BSI4 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TINF2Q9BSI4 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TINF2Q9BSI4 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TINF2Q9BSI4 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TINF2Q9BSI4 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TINF2Q9BSI4 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
TINF2Q9BSI4 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TINF2Q9BSI4 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TINF2Q9BSI4 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TINF2Q9BSI4 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TINF2Q9BSI4 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TINF2Q9BSI4 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TINF2Q9BSI4 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TINF2Q9BSI4 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TINF2Q9BSI4 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TINF2Q9BSI4 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TINF2Q9BSI4 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TINF2Q9BSI4 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TINF2Q9BSI4 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TINF2Q9BSI4 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TINF2Q9BSI4 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TINF2Q9BSI4 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TINF2Q9BSI4 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TINF2Q9BSI4 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TINF2Q9BSI4 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TINF2Q9BSI4 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TINF2Q9BSI4 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TINF2Q9BSI4 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TINF2Q9BSI4 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TINF2Q9BSI4 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TINF2Q9BSI4 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TINF2Q9BSI4 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
TINF2Q9BSI4 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TINF2Q9BSI4 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TINF2Q9BSI4 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TINF2Q9BSI4 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TINF2Q9BSI4 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TINF2Q9BSI4 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TINF2Q9BSI4 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TINF2Q9BSI4 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TINF2Q9BSI4 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TINF2Q9BSI4 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TINF2Q9BSI4 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TINF2Q9BSI4 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TINF2Q9BSI4 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
TINF2Q9BSI4 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TINF2Q9BSI4 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TINF2Q9BSI4 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TINF2Q9BSI4 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TINF2Q9BSI4 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TINF2Q9BSI4 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TINF2Q9BSI4 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TINF2Q9BSI4 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TINF2Q9BSI4 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TINF2Q9BSI4 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TINF2Q9BSI4 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TINF2Q9BSI4 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
TINF2Q9BSI4 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TINF2Q9BSI4 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TINF2Q9BSI4 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TINF2Q9BSI4 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
TINF2Q9BSI4 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TINF2Q9BSI4 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TINF2Q9BSI4 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TINF2Q9BSI4 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TINF2Q9BSI4 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TINF2Q9BSI4 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TINF2Q9BSI4 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TINF2Q9BSI4 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TINF2Q9BSI4 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TINF2Q9BSI4 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TINF2Q9BSI4 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TINF2Q9BSI4 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TINF2Q9BSI4 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TINF2Q9BSI4 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TINF2Q9BSI4 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TINF2Q9BSI4 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TINF2Q9BSI4 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TINF2Q9BSI4 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TINF2Q9BSI4 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TINF2Q9BSI4 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TINF2Q9BSI4 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TINF2Q9BSI4 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TINF2Q9BSI4 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TINF2Q9BSI4 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TINF2Q9BSI4 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TINF2Q9BSI4 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TINF2Q9BSI4 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TINF2Q9BSI4 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TINF2Q9BSI4 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TINF2Q9BSI4 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TINF2Q9BSI4 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms