Protein–RNA interactions for Protein: Q99666

RGPD5, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 5/6, humanhuman

Predictions only

Length 1,765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD5Q99666 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RGPD5Q99666 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RGPD5Q99666 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RGPD5Q99666 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RGPD5Q99666 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RGPD5Q99666 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RGPD5Q99666 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RGPD5Q99666 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RGPD5Q99666 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RGPD5Q99666 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RGPD5Q99666 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RGPD5Q99666 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RGPD5Q99666 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RGPD5Q99666 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RGPD5Q99666 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RGPD5Q99666 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RGPD5Q99666 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RGPD5Q99666 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RGPD5Q99666 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RGPD5Q99666 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RGPD5Q99666 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RGPD5Q99666 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RGPD5Q99666 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RGPD5Q99666 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RGPD5Q99666 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
RGPD5Q99666 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RGPD5Q99666 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RGPD5Q99666 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RGPD5Q99666 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RGPD5Q99666 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RGPD5Q99666 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RGPD5Q99666 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RGPD5Q99666 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RGPD5Q99666 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RGPD5Q99666 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RGPD5Q99666 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RGPD5Q99666 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RGPD5Q99666 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RGPD5Q99666 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RGPD5Q99666 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RGPD5Q99666 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
RGPD5Q99666 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RGPD5Q99666 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RGPD5Q99666 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RGPD5Q99666 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RGPD5Q99666 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RGPD5Q99666 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RGPD5Q99666 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
RGPD5Q99666 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RGPD5Q99666 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
RGPD5Q99666 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RGPD5Q99666 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RGPD5Q99666 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RGPD5Q99666 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
RGPD5Q99666 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RGPD5Q99666 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RGPD5Q99666 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RGPD5Q99666 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RGPD5Q99666 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RGPD5Q99666 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RGPD5Q99666 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RGPD5Q99666 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RGPD5Q99666 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RGPD5Q99666 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RGPD5Q99666 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RGPD5Q99666 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RGPD5Q99666 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RGPD5Q99666 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RGPD5Q99666 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RGPD5Q99666 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RGPD5Q99666 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RGPD5Q99666 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RGPD5Q99666 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RGPD5Q99666 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RGPD5Q99666 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RGPD5Q99666 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RGPD5Q99666 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RGPD5Q99666 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RGPD5Q99666 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RGPD5Q99666 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RGPD5Q99666 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RGPD5Q99666 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RGPD5Q99666 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RGPD5Q99666 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RGPD5Q99666 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RGPD5Q99666 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RGPD5Q99666 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RGPD5Q99666 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RGPD5Q99666 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RGPD5Q99666 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RGPD5Q99666 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RGPD5Q99666 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RGPD5Q99666 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RGPD5Q99666 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RGPD5Q99666 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RGPD5Q99666 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RGPD5Q99666 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RGPD5Q99666 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RGPD5Q99666 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RGPD5Q99666 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms