Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
VAT1Q99536 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VAT1Q99536 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VAT1Q99536 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VAT1Q99536 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
VAT1Q99536 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
VAT1Q99536 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
VAT1Q99536 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
VAT1Q99536 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
VAT1Q99536 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
VAT1Q99536 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
VAT1Q99536 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
VAT1Q99536 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
VAT1Q99536 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
VAT1Q99536 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
VAT1Q99536 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
VAT1Q99536 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
VAT1Q99536 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
VAT1Q99536 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
VAT1Q99536 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
VAT1Q99536 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
VAT1Q99536 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
VAT1Q99536 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
VAT1Q99536 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
VAT1Q99536 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
VAT1Q99536 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
VAT1Q99536 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
VAT1Q99536 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
VAT1Q99536 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
VAT1Q99536 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
VAT1Q99536 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
VAT1Q99536 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
VAT1Q99536 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
VAT1Q99536 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
VAT1Q99536 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
VAT1Q99536 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
VAT1Q99536 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
VAT1Q99536 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
VAT1Q99536 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
VAT1Q99536 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
VAT1Q99536 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
VAT1Q99536 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
VAT1Q99536 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
VAT1Q99536 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
VAT1Q99536 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
VAT1Q99536 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
VAT1Q99536 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
VAT1Q99536 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
VAT1Q99536 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
VAT1Q99536 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
VAT1Q99536 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
VAT1Q99536 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
VAT1Q99536 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
VAT1Q99536 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
VAT1Q99536 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
VAT1Q99536 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
VAT1Q99536 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
VAT1Q99536 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
VAT1Q99536 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
VAT1Q99536 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
VAT1Q99536 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
VAT1Q99536 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
VAT1Q99536 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
VAT1Q99536 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
VAT1Q99536 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
VAT1Q99536 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
VAT1Q99536 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
VAT1Q99536 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
VAT1Q99536 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
VAT1Q99536 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
VAT1Q99536 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
VAT1Q99536 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
VAT1Q99536 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
VAT1Q99536 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
VAT1Q99536 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
VAT1Q99536 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
VAT1Q99536 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
VAT1Q99536 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
VAT1Q99536 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
VAT1Q99536 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
VAT1Q99536 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
VAT1Q99536 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
VAT1Q99536 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
VAT1Q99536 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
VAT1Q99536 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
VAT1Q99536 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
VAT1Q99536 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
VAT1Q99536 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
VAT1Q99536 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
VAT1Q99536 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
VAT1Q99536 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
VAT1Q99536 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
VAT1Q99536 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
VAT1Q99536 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
VAT1Q99536 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
VAT1Q99536 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
VAT1Q99536 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
VAT1Q99536 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
VAT1Q99536 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
VAT1Q99536 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms